140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0889 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  40.61 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  37.75 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  39.2 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  33.67 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  33.97 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  33.97 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  33.49 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  33.67 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  35.15 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  34.36 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  33.83 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  37.72 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  32.99 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  32.84 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  34.34 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  34.33 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  34.24 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  34.52 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  33.7 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  35.27 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  35.59 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  32.66 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  32.16 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  32.16 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  31.66 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  32.32 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  31.66 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  28.88 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  34.38 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  29.52 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.38 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  29.85 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  29.79 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  33.53 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  29.52 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  31.2 
 
 		 243 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  31.34 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  28.8 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  30.5 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  30.69 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  28.93 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  28.43 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  28 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28 
 
 		 246 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  29.28 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  30.63 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  28.08 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  29.65 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  26.9 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.79 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  32.94 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  31.76 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  31.76 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  29.09 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  30.21 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  27.39 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  27.44 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  27.44 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  26.71 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  26.71 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  26.71 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  26.71 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  26.71 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  26.71 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  23.91 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  26.71 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  28.18 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  26.83 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  27.39 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  23.67 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  24.26 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  26.51 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  26.38 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  33.72 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  23.58 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  27.16 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  39.74 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  25.41 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  25.41 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  32.53 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  25.41 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  25.41 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  32.26 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  26.19 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  25.41 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  26.19 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  26.19 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  27.44 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  24.84 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  26.19 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  23.38 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  26.44 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  26.14 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  28.05 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>