140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004037 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  75.74 
 
 		 171 aa  275  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  59.2 
 
 		 200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  35.5 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  37.75 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  37.93 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  38.12 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  37.06 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  35.75 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  32.91 
 
 		 243 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  36.14 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  36.07 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  35.05 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  37.06 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  35.23 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  37.06 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  37.06 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  35.61 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  35.52 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  34.01 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  36.55 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  35.94 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  35.64 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  32.99 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  36.76 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  33.5 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  34.48 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  37.88 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  33.99 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  33.5 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  36.47 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  35.84 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  35.48 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  33.91 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  32.14 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  32.99 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  32.43 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  32.4 
 
 		 227 aa  91.7  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  31.67 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  30.69 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  31.28 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  26.5 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  29.69 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  30.96 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  33.33 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  31.64 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  30.73 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  31.58 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  30.21 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  32.66 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  30.21 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  27.41 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  28.92 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  30.39 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  30.29 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  29.95 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  26.71 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  27.38 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  30.91 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  24.19 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  25.3 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  26.38 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.66 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.66 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  26.38 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.48 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  25.9 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  22.58 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  25.48 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  24.28 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  25.9 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  26.42 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  25.3 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  25.3 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  26.42 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  23.81 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  26.42 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  26.42 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  26.42 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  26.42 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  26.42 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  26.42 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  22.04 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  25.9 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  27.01 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  21.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  23.64 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  21.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  21.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  21.51 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  20.53 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  25.41 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>