22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45608 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35345  predicted protein  98.54 
 
 
342 aa  692    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000143733  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45608  predicted protein  100 
 
 
342 aa  703    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 
199 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  30.47 
 
 
197 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  30.47 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  29.33 
 
 
199 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  29.33 
 
 
199 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  26.81 
 
 
199 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  29.41 
 
 
202 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 
199 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  27.69 
 
 
200 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  28.91 
 
 
197 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  28.91 
 
 
199 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  27.01 
 
 
245 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  30.47 
 
 
213 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  29.01 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  27.69 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  25.53 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  22.3 
 
 
236 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  23.03 
 
 
198 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  24.44 
 
 
201 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>