More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2287 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2287  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  951    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000712178  hitchhiker  0.00000369164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1888  response regulator receiver protein  50.48 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0895  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 250 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  42.48 
 
 		 351 aa  86.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  32.24 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 944 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  39.22 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  33.05 
 
 		 160 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1330  response regulator receiver  33.98 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  38.61 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 2175 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 121 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 121 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  46.38 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  31.93 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0999  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.89 
 
 		 872 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 2212 aa  63.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0726  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.48 
 
 		 1960 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 1725 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 383 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 1725 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  35.06 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 121 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.56 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 121 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 121 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1362 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 2022 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  34.65 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  32 
 
 		 2301 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.19 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.65 
 
 		 711 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  38.1 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  30 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  31.36 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 1832 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  36.64 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  29.5 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.69 
 
 		 1499 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 2414 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  30.43 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2017  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  30.97 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  31.09 
 
 		 121 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 123 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.4 
 
 		 1053 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1629 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  33.02 
 
 		 120 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 123 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  32.08 
 
 		 121 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.59 
 
 		 1361 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0360  chemotaxis-specific methylesterase  34.71 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.31 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.9 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  31.09 
 
 		 121 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.23 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  32.77 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.45 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.45 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.82 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.62 
 
 		 2336 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 121 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 911 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 911 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 1299 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  34.29 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>