More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0392 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  100 
 
 		 351 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1888  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 		 121 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 121 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 		 121 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 121 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  40.19 
 
 		 121 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 121 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.05 
 
 		 121 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  40 
 
 		 763 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  38.94 
 
 		 121 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2287  response regulator receiver domain-containing protein  42.48 
 
 		 460 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000712178  hitchhiker  0.00000369164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 121 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 121 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  28.5 
 
 		 1127 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  39.5 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  37.62 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.38 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  38.4 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.53 
 
 		 2301 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.27 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.57 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 869 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 120 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  36.92 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  38.76 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.61 
 
 		 2284 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 124 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 122 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.54 
 
 		 1866 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.17 
 
 		 2336 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 120 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 827 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 2099 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  37.84 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  38.68 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  34.65 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 1629 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  39.81 
 
 		 1133 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.18 
 
 		 704 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.53 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  37.72 
 
 		 1161 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 146 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.2 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  34.48 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  34.48 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 2212 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  34.96 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 2099 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1609 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.88 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  36.97 
 
 		 1989 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 		 1130 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 125 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 2137 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1792 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 1725 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 1725 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  37.86 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.83 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 2539 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 2423 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  44.44 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1839 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.83 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 939 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 161 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>