More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3789 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  100 
 
 		 575 aa  1137    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  56.08 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 		 572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  31.12 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 		 669 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  27.85 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  22 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  25.61 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.23 
 
 		 1024 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  27.9 
 
 		 334 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  25.2 
 
 		 529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  24.28 
 
 		 561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.13 
 
 		 1003 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 1000 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.28 
 
 		 1008 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.28 
 
 		 1008 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  25.26 
 
 		 986 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.31 
 
 		 1001 aa  104  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  26.17 
 
 		 739 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.24 
 
 		 720 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  23.96 
 
 		 975 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  25.53 
 
 		 741 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.39 
 
 		 971 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  26.36 
 
 		 733 aa  98.2  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  23.36 
 
 		 930 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 720 aa  97.8  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.63 
 
 		 695 aa  96.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.45 
 
 		 721 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  24.33 
 
 		 726 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  23.69 
 
 		 982 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  24.77 
 
 		 705 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.58 
 
 		 1013 aa  95.9  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.4 
 
 		 980 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  27.06 
 
 		 594 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.12 
 
 		 1012 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  21.92 
 
 		 999 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.67 
 
 		 976 aa  94  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.23 
 
 		 1006 aa  93.6  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  24.61 
 
 		 720 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  23.36 
 
 		 330 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  24.69 
 
 		 906 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  24.69 
 
 		 906 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  22.53 
 
 		 1038 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.47 
 
 		 1019 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  22.53 
 
 		 1038 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  23.57 
 
 		 731 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  25.97 
 
 		 1636 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  24.48 
 
 		 724 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  24.48 
 
 		 724 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  27.08 
 
 		 714 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  31.08 
 
 		 1284 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  24.51 
 
 		 578 aa  88.6  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.15 
 
 		 865 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.03 
 
 		 1016 aa  88.2  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  23.63 
 
 		 892 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  23.68 
 
 		 722 aa  87.8  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  24.38 
 
 		 731 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  27.08 
 
 		 728 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  23.99 
 
 		 720 aa  87.4  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.71 
 
 		 908 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  28.3 
 
 		 726 aa  87  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  22.08 
 
 		 725 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  24.84 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  26.42 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  22.32 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  29.3 
 
 		 719 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  21.86 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  25.35 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  24.07 
 
 		 728 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  23.32 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1714  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  34.09 
 
 		 569 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  28.16 
 
 		 753 aa  83.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  25.75 
 
 		 577 aa  83.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  24.07 
 
 		 572 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  23.11 
 
 		 712 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.63 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.73 
 
 		 782 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3550  ABC transporter related  31.33 
 
 		 1155 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00603168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  31.67 
 
 		 1231 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  30.15 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  26.99 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  29.67 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  26.18 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  24.39 
 
 		 700 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  30.55 
 
 		 1230 aa  79.7  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  26 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  23.78 
 
 		 723 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  28.4 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  30.77 
 
 		 593 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  31.6 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.91 
 
 		 1013 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  22.44 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  25.05 
 
 		 602 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 		 595 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  20.08 
 
 		 968 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  21.72 
 
 		 714 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  30 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  22.39 
 
 		 716 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  24.59 
 
 		 672 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>