18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3995 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  100 
 
 		 334 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  55.03 
 
 		 330 aa  321  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  47.45 
 
 		 551 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  45.03 
 
 		 551 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  43.91 
 
 		 561 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 669 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  32.59 
 
 		 552 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.15 
 
 		 566 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  26.1 
 
 		 559 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.9 
 
 		 575 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 		 572 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  29.55 
 
 		 529 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  29.55 
 
 		 529 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  20.56 
 
 		 739 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  24.24 
 
 		 1038 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  24.24 
 
 		 1038 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  30 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.32 
 
 		 1012 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>