More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0708 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  100 
 
 		 561 aa  1138    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  37.82 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  38.24 
 
 		 551 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 334 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  29.12 
 
 		 552 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  27.9 
 
 		 669 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  39.43 
 
 		 330 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  25.05 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  25.86 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  22.66 
 
 		 559 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  25.39 
 
 		 968 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  24.28 
 
 		 575 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  25.99 
 
 		 602 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.59 
 
 		 1003 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  21.18 
 
 		 572 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.65 
 
 		 980 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.89 
 
 		 1006 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.93 
 
 		 999 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  28.91 
 
 		 1218 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  28.91 
 
 		 1218 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  28.91 
 
 		 1218 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.08 
 
 		 1019 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  27.21 
 
 		 712 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  28.57 
 
 		 1218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  28.57 
 
 		 1218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  23.99 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  27.21 
 
 		 712 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  23.28 
 
 		 722 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  27.21 
 
 		 712 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  22.91 
 
 		 930 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  27.11 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  23.49 
 
 		 986 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  23.69 
 
 		 721 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.29 
 
 		 738 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  23.76 
 
 		 734 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.06 
 
 		 573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  24.32 
 
 		 734 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.32 
 
 		 976 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  25.24 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.54 
 
 		 1001 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.35 
 
 		 1008 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  25.6 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.35 
 
 		 1008 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  23.34 
 
 		 738 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  22.24 
 
 		 716 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  21.97 
 
 		 576 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  26.53 
 
 		 720 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1685  ABC transporter related protein  23.51 
 
 		 574 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1123  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 616 aa  110  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.59 
 
 		 1024 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  22.89 
 
 		 1038 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  22.24 
 
 		 580 aa  110  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  21.4 
 
 		 736 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  24.17 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  22.89 
 
 		 1038 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  21.65 
 
 		 643 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  24.75 
 
 		 566 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  22.87 
 
 		 727 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.94 
 
 		 1000 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  22.28 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.12 
 
 		 724 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  23.66 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.12 
 
 		 724 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  23.08 
 
 		 892 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.9 
 
 		 865 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  26.45 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  21.65 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  26.21 
 
 		 711 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  27.5 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  22.44 
 
 		 576 aa  107  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  24.56 
 
 		 742 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  22.49 
 
 		 971 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  26.21 
 
 		 619 aa  107  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  23.4 
 
 		 581 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  25.74 
 
 		 566 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  22.24 
 
 		 568 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  26.51 
 
 		 741 aa  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.89 
 
 		 908 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2488  ABC transporter related  24.03 
 
 		 596 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  26.8 
 
 		 741 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.91 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  23.55 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  30.99 
 
 		 720 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  24.94 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  31.37 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  26.78 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  23.89 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  23.15 
 
 		 567 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  26.94 
 
 		 584 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  24.76 
 
 		 587 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  23.91 
 
 		 739 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  24.93 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  23.32 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  26.23 
 
 		 731 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  25.07 
 
 		 723 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  24.11 
 
 		 770 aa  104  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  23.15 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  25.25 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  23.37 
 
 		 613 aa  104  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  27.12 
 
 		 712 aa  104  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>