More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0403 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  100 
 
 		 566 aa  1118    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  56.08 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 559 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 		 572 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  31.1 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.42 
 
 		 669 aa  164  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  29.15 
 
 		 334 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  24.79 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  22.53 
 
 		 551 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  26.58 
 
 		 529 aa  140  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  25.6 
 
 		 529 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  22.29 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  24.68 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.19 
 
 		 695 aa  94.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  24.81 
 
 		 589 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  23.45 
 
 		 982 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  26.03 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.46 
 
 		 1024 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.55 
 
 		 1008 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.55 
 
 		 1008 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  23.73 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24 
 
 		 1003 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  26.94 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.31 
 
 		 999 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  25.39 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.61 
 
 		 782 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.44 
 
 		 721 aa  80.1  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 1000 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.76 
 
 		 1001 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  21.76 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.37 
 
 		 908 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  22.68 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  22.72 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  21.05 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  25.17 
 
 		 603 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  24.45 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  22.69 
 
 		 1040 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  25.97 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  25.13 
 
 		 714 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  24.01 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  24.6 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  21.73 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  20.68 
 
 		 968 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  23.84 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  21.55 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.21 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  23.77 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  24.71 
 
 		 577 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.26 
 
 		 1019 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 604 aa  73.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.04 
 
 		 586 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  24.64 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  22.99 
 
 		 576 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  20.77 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  21.34 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  24.64 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  22.95 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  23.62 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.82 
 
 		 1013 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  23.62 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  21.06 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.37 
 
 		 1006 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  22.13 
 
 		 578 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  26.26 
 
 		 581 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  22.97 
 
 		 906 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  24.05 
 
 		 721 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  25.68 
 
 		 1301 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  22.59 
 
 		 586 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  23.62 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  26.95 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  23.62 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  23.78 
 
 		 986 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.09 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.09 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.58 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  23.7 
 
 		 721 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  19.03 
 
 		 701 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  25.71 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  24.85 
 
 		 641 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  22.77 
 
 		 906 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  23.02 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.06 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  25.46 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.06 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  26.72 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  23.29 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  26.72 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  23.76 
 
 		 593 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  26.53 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  24.41 
 
 		 598 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  22.38 
 
 		 908 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3110  ABC transporter related protein  25.09 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  26.46 
 
 		 784 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  30.09 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  22.87 
 
 		 733 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  23.82 
 
 		 739 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  22.29 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  22.86 
 
 		 572 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  23.36 
 
 		 572 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  20.97 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>