20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2829 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  55.03 
 
 		 334 aa  355  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  40.31 
 
 		 551 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  38.1 
 
 		 551 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  39.51 
 
 		 561 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 669 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  31.39 
 
 		 529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  31.39 
 
 		 529 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  27.61 
 
 		 552 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  25.16 
 
 		 559 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  24.35 
 
 		 566 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  23.31 
 
 		 572 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  22.96 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  24.14 
 
 		 1011 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  22.32 
 
 		 722 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  20.28 
 
 		 717 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.16 
 
 		 1013 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  21.6 
 
 		 908 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  25.23 
 
 		 695 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  19.35 
 
 		 1332 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>