More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3961 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  100 
 
 		 551 aa  1123    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  48.8 
 
 		 551 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  38.24 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  47.45 
 
 		 334 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  30.37 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  27.14 
 
 		 669 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  38.1 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  24.86 
 
 		 559 aa  183  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  26.62 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  26.24 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  23.49 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  25.66 
 
 		 726 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  27.61 
 
 		 1230 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  24.13 
 
 		 581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0940  ABC transporter related  30.18 
 
 		 908 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000214884  normal  0.092594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  23.3 
 
 		 1218 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  22.61 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  28.44 
 
 		 737 aa  134  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  22.91 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  24.68 
 
 		 572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  23.4 
 
 		 573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  23.65 
 
 		 573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  28.32 
 
 		 574 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  23.65 
 
 		 573 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  23.4 
 
 		 573 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0113  ABC transporter related  28.57 
 
 		 919 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  23.4 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  23.4 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  23.4 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  24.32 
 
 		 730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  24.52 
 
 		 583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  24.82 
 
 		 737 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  23.29 
 
 		 1194 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  23.93 
 
 		 572 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  26.9 
 
 		 720 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2757  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  23.15 
 
 		 573 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  27.3 
 
 		 718 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  26.4 
 
 		 723 aa  127  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  27.24 
 
 		 704 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2231  hypothetical protein  28.48 
 
 		 739 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.84 
 
 		 1008 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  27.3 
 
 		 718 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  28.28 
 
 		 730 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.84 
 
 		 1008 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.19 
 
 		 711 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  25.54 
 
 		 1717 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.3 
 
 		 1024 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  26.51 
 
 		 1218 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0283  ABC transporter related protein  27.16 
 
 		 604 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  26.51 
 
 		 1218 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  24.47 
 
 		 762 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  26.51 
 
 		 1218 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.98 
 
 		 694 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0959  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  22.91 
 
 		 573 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  26.51 
 
 		 1218 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  23.4 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  28.62 
 
 		 1040 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  26.2 
 
 		 1218 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 584 aa  123  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  26.33 
 
 		 721 aa  123  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  24.32 
 
 		 704 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.93 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  32.27 
 
 		 725 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  24.56 
 
 		 756 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  23.66 
 
 		 982 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  27.65 
 
 		 729 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  27.18 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  23.03 
 
 		 1284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  24.16 
 
 		 730 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.24 
 
 		 606 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2945  ABC transporter related  30.73 
 
 		 723 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.658105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  26.19 
 
 		 566 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  25.17 
 
 		 699 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1685  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2165  ABC transporter related  31.37 
 
 		 581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  34.58 
 
 		 742 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.96 
 
 		 908 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  25.3 
 
 		 725 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  24.22 
 
 		 705 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  28.15 
 
 		 720 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  27.83 
 
 		 723 aa  120  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.36 
 
 		 584 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  22.69 
 
 		 740 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  26.3 
 
 		 572 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  25.59 
 
 		 586 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  26.75 
 
 		 779 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  26.3 
 
 		 572 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  26.53 
 
 		 739 aa  120  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.03 
 
 		 717 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 		 707 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  26.32 
 
 		 721 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.76 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  26.77 
 
 		 726 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  26.46 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  24.35 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.3 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  23.22 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  26.69 
 
 		 719 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  23.49 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  22.73 
 
 		 722 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>