More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0113 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0940  ABC transporter related  48.96 
 
 		 908 aa  894    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000214884  normal  0.092594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0113  ABC transporter related  100 
 
 		 919 aa  1875    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1128  ABC transporter, transmembrane region  43.47 
 
 		 953 aa  596  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0416332  normal  0.0760637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0874  ATPase  42.08 
 
 		 741 aa  593  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.889196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2330  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 741 aa  592  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  37.83 
 
 		 1675 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3041  ABC transporter related  36.72 
 
 		 950 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  33.23 
 
 		 1717 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0091  ABC transporter related  42.49 
 
 		 981 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0407  ABC transporter related  39.68 
 
 		 964 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2945  ABC transporter related  37.73 
 
 		 723 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.658105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2231  hypothetical protein  40.4 
 
 		 739 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6119  ABC transporter related  39.85 
 
 		 893 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2501  ATPase  32.25 
 
 		 917 aa  357  3.9999999999999996e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608162  normal  0.380324 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15691  hypothetical protein  33.96 
 
 		 473 aa  289  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  32.19 
 
 		 726 aa  287  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 743 aa  284  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.9 
 
 		 1024 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  31.88 
 
 		 721 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 1000 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.04 
 
 		 720 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.15 
 
 		 986 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.3 
 
 		 1003 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  30.8 
 
 		 741 aa  252  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  27.91 
 
 		 930 aa  252  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  32.04 
 
 		 700 aa  250  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.14 
 
 		 1001 aa  250  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.45 
 
 		 731 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.34 
 
 		 999 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.96 
 
 		 1008 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.96 
 
 		 1008 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.57 
 
 		 971 aa  247  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  30.02 
 
 		 770 aa  246  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  30.32 
 
 		 712 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  27.13 
 
 		 968 aa  244  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  29.85 
 
 		 767 aa  243  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.48 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.12 
 
 		 1019 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.57 
 
 		 980 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.83 
 
 		 1012 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.97 
 
 		 865 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.31 
 
 		 734 aa  241  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.16 
 
 		 1016 aa  240  9e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.55 
 
 		 976 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  29.17 
 
 		 975 aa  239  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 892 aa  238  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.38 
 
 		 739 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.3 
 
 		 1013 aa  237  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  29.74 
 
 		 706 aa  237  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.4 
 
 		 753 aa  237  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.14 
 
 		 727 aa  237  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 906 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  30.16 
 
 		 908 aa  234  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  30.09 
 
 		 699 aa  234  6e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.27 
 
 		 725 aa  234  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.51 
 
 		 743 aa  234  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 		 906 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.8 
 
 		 908 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  26.88 
 
 		 737 aa  233  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  27.73 
 
 		 742 aa  232  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  29.56 
 
 		 728 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  28.55 
 
 		 741 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 1006 aa  231  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.49 
 
 		 750 aa  231  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.9 
 
 		 720 aa  231  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.56 
 
 		 728 aa  231  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.28 
 
 		 597 aa  230  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  28.47 
 
 		 726 aa  230  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.45 
 
 		 739 aa  229  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  29.63 
 
 		 721 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  30.43 
 
 		 719 aa  229  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.99 
 
 		 731 aa  229  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.45 
 
 		 705 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.42 
 
 		 738 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  29.68 
 
 		 715 aa  228  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  26.77 
 
 		 726 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.44 
 
 		 1013 aa  228  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  29.27 
 
 		 726 aa  227  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.64 
 
 		 739 aa  227  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.26 
 
 		 725 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 1038 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.32 
 
 		 1018 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 1038 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 		 712 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  28.73 
 
 		 712 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.88 
 
 		 720 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.19 
 
 		 721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  25.5 
 
 		 982 aa  223  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  27.57 
 
 		 720 aa  222  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.02 
 
 		 1018 aa  222  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.15 
 
 		 1042 aa  221  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.14 
 
 		 738 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  28.98 
 
 		 720 aa  221  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  32.24 
 
 		 683 aa  221  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31 
 
 		 632 aa  220  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.32 
 
 		 724 aa  220  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  30.61 
 
 		 725 aa  220  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  30.06 
 
 		 707 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.32 
 
 		 724 aa  220  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.67 
 
 		 1018 aa  220  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>