More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0282 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1144    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  58.15 
 
 		 572 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  39.06 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  34.15 
 
 		 566 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  29.51 
 
 		 552 aa  223  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.07 
 
 		 669 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  24.86 
 
 		 551 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  24.3 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  22.66 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  26.1 
 
 		 334 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  27.18 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  26.56 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24 
 
 		 1000 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  25.16 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.74 
 
 		 1008 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.74 
 
 		 1008 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.7 
 
 		 1024 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  22.75 
 
 		 971 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  23.88 
 
 		 906 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  21.26 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  21.76 
 
 		 976 aa  92.8  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  23.2 
 
 		 930 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  23.69 
 
 		 906 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  23.88 
 
 		 908 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.82 
 
 		 1013 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  20.93 
 
 		 728 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  20.77 
 
 		 728 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  22.42 
 
 		 975 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.66 
 
 		 1003 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  20.32 
 
 		 712 aa  87  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  20.3 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.16 
 
 		 908 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  23.58 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  22.15 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  20.32 
 
 		 712 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  20.32 
 
 		 712 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  23.64 
 
 		 1218 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  22.38 
 
 		 720 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  21.26 
 
 		 720 aa  84.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  22.31 
 
 		 865 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  21.51 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  23.71 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  20.24 
 
 		 999 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  20.89 
 
 		 724 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  21.43 
 
 		 720 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  21.85 
 
 		 892 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  20.89 
 
 		 724 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  22 
 
 		 741 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  20.49 
 
 		 722 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  23.79 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.49 
 
 		 1001 aa  80.9  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  21.73 
 
 		 980 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  22.03 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  22.66 
 
 		 601 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  23.83 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  23.68 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  21.81 
 
 		 739 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  21.92 
 
 		 594 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  19.06 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.27 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  21.68 
 
 		 593 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  23.45 
 
 		 606 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  22.35 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  22.48 
 
 		 1011 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  20.16 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  19.62 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.27 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  20.49 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.27 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  22.29 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  22.27 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  22.07 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.29 
 
 		 1006 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  22.29 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.07 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  23.63 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  20.45 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.18 
 
 		 621 aa  75.1  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  19.05 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.96 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  19.05 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  24.48 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  19.68 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  22.25 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  19.64 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  21.01 
 
 		 968 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  21.89 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  20.27 
 
 		 982 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  19.69 
 
 		 572 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  19.59 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.68 
 
 		 608 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  21.08 
 
 		 986 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  22.27 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  18.37 
 
 		 725 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  20.26 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  24.18 
 
 		 1301 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  24.8 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  20.42 
 
 		 726 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  21.85 
 
 		 1231 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  24.38 
 
 		 606 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>