More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00632 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  58.15 
 
 		 559 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 572 aa  1171    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  38.48 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  34.97 
 
 		 566 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  28.83 
 
 		 552 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.1 
 
 		 669 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  23.49 
 
 		 551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  23.43 
 
 		 551 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  26.5 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  26.28 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  26.67 
 
 		 334 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  21.18 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.14 
 
 		 1024 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  23.02 
 
 		 930 aa  90.5  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  23.31 
 
 		 330 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  21.64 
 
 		 722 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  21.63 
 
 		 980 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  20.96 
 
 		 976 aa  86.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  23.83 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  23.98 
 
 		 1013 aa  86.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  20.08 
 
 		 1008 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  20.08 
 
 		 1008 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.09 
 
 		 621 aa  82  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  23.59 
 
 		 906 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  22.64 
 
 		 601 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  23.78 
 
 		 572 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.52 
 
 		 1000 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  23.24 
 
 		 906 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  23.71 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  20.8 
 
 		 975 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.09 
 
 		 1003 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  24.9 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  24.82 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.42 
 
 		 908 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  24.82 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  24.47 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  24.02 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  22.2 
 
 		 720 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  22.27 
 
 		 719 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  20.83 
 
 		 715 aa  77  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  20.23 
 
 		 592 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.73 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  23 
 
 		 908 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  26.12 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  25.1 
 
 		 633 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.28 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.28 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  22.28 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  22.38 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  23.41 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  21.21 
 
 		 892 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  22.28 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  21.39 
 
 		 1001 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.28 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  22.39 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  22.28 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  20.31 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  20.04 
 
 		 971 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  22.28 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  25.9 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  21.49 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  23.41 
 
 		 712 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  23.41 
 
 		 712 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  21.24 
 
 		 594 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.73 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  26.12 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  21.62 
 
 		 631 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  21.62 
 
 		 631 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  21.78 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  25.51 
 
 		 591 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  29.03 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  21.21 
 
 		 631 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  21.89 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  21.76 
 
 		 567 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  23.78 
 
 		 368 aa  72  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  24.11 
 
 		 634 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  21.76 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  25.77 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  25.77 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  22.75 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  21.44 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  27.53 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  20.31 
 
 		 986 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  26.39 
 
 		 612 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  19.92 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  23.73 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  26.32 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  22.76 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  26.02 
 
 		 743 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  22.68 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  21.86 
 
 		 716 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  18.99 
 
 		 1013 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.19 
 
 		 1016 aa  70.5  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  21.76 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  22.82 
 
 		 590 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0902  hypothetical protein  21.61 
 
 		 562 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  24.41 
 
 		 596 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.61 
 
 		 721 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  23.99 
 
 		 568 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.18 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>