More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2026 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2026  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 669 aa  1353    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2223  ABC transporter related  33.94 
 
 		 552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00699349  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06480  HlyB/MsbA family ABC transporter  28.34 
 
 		 551 aa  268  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3961  ABC transporter related  27.14 
 
 		 551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00632  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.1 
 
 		 572 aa  239  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0708  ABC transporter related  27.9 
 
 		 561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208572  normal  0.375229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0282  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.07 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.999877  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3789  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.29 
 
 		 575 aa  206  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0278  hypothetical protein  29.29 
 
 		 529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0283  hypothetical protein  29.42 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3995  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 334 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  hitchhiker  0.000000106832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0403  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.27 
 
 		 566 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2829  hypothetical protein  30.77 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000175796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.43 
 
 		 1019 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  23.99 
 
 		 1038 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  23.99 
 
 		 1038 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  22.42 
 
 		 722 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  25.47 
 
 		 634 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  24.8 
 
 		 641 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  21.58 
 
 		 722 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  25.64 
 
 		 633 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  24.57 
 
 		 650 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  24.57 
 
 		 650 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  20.1 
 
 		 736 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  22.05 
 
 		 585 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  23.2 
 
 		 1040 aa  97.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.73 
 
 		 1018 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  23.32 
 
 		 1018 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.98 
 
 		 586 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  29.21 
 
 		 606 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  25.62 
 
 		 906 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  22.65 
 
 		 906 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  22.45 
 
 		 715 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  22.94 
 
 		 617 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.13 
 
 		 1018 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  24.78 
 
 		 1218 aa  91.3  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  23.3 
 
 		 594 aa  91.3  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2165  ABC transporter related  24.62 
 
 		 581 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  26.52 
 
 		 584 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  22.4 
 
 		 583 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  27 
 
 		 590 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  19.93 
 
 		 717 aa  87.8  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  22.39 
 
 		 721 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  22.06 
 
 		 980 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  24.95 
 
 		 592 aa  87  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.06 
 
 		 641 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  23.8 
 
 		 715 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  24.25 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  22.87 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  21.46 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.41 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  28.33 
 
 		 594 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.02 
 
 		 908 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  27.05 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  25.59 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  23.82 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  21.9 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.05 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.58 
 
 		 1006 aa  84.3  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  22.67 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  23.29 
 
 		 368 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  20.28 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.4 
 
 		 627 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  21.49 
 
 		 712 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  23.9 
 
 		 714 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  22.22 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  21.52 
 
 		 1013 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.22 
 
 		 591 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  23.2 
 
 		 748 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.67 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  22.89 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  21.15 
 
 		 1003 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  21.61 
 
 		 625 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  20.4 
 
 		 982 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  21.8 
 
 		 892 aa  81.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  23.84 
 
 		 1301 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  21.14 
 
 		 712 aa  81.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  24.45 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  25 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  24.04 
 
 		 1675 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  23.55 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  25.77 
 
 		 779 aa  80.9  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  23.29 
 
 		 763 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  22.61 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.29 
 
 		 763 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  21.43 
 
 		 782 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  20.88 
 
 		 615 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  22.71 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  21.8 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  21.8 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  22.91 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  20.93 
 
 		 1001 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  22.11 
 
 		 741 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  23.71 
 
 		 593 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  24.95 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  24.22 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0164  ABC transporter related  25.52 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  23.39 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2233  ABC transporter related  24.14 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>