More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1969 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  58.14 
 
 		 301 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  55.66 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  56.62 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  55.45 
 
 		 302 aa  332  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  54.93 
 
 		 303 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  54.15 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  55.78 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  54.61 
 
 		 303 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  54.61 
 
 		 303 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  55.3 
 
 		 301 aa  329  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  55.45 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  54.28 
 
 		 303 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  54.49 
 
 		 299 aa  328  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  54.79 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  53.82 
 
 		 298 aa  318  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  33.7 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.68 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  41.43 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  31.92 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.78 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.02 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.36 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  40.98 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  40.98 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.61 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  43.06 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.22 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.8 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.14 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  35.52 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.84 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  40.87 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 330 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  41.63 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  40.49 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  37.02 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.44 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  35.29 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.02 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.58 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  30.97 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.16 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.32 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.16 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.62 
 
 		 240 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40.38 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  35.24 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  37.8 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  39.51 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.89 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  36.65 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.9 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 346 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.65 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.5 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  33.49 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  38.24 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  38.89 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  33.74 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  36.7 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.81 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.13 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.38 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  33.33 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.24 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  39.25 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  40.47 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.59 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.6 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  37.32 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  39.32 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.45 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.41 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>