More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2284 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  62.88 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  61.26 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  60.93 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  61.59 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  60.6 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  59.87 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  59.53 
 
 		 301 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  58.75 
 
 		 303 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  57.86 
 
 		 299 aa  358  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  58.19 
 
 		 301 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  58.42 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  58.42 
 
 		 303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  58.44 
 
 		 308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  58.42 
 
 		 303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 301 aa  318  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.39 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.75 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  29.3 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  39.15 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  38.05 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.89 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  35.89 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.8 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  31.08 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  30.87 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  30.59 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  36.92 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.89 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.21 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  32.18 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  38.36 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.46 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  35.89 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  32.72 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  31.46 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.35 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  30.32 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.33 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.72 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  33.83 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  30.2 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  37.68 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.98 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.64 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  39.21 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  32.61 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.35 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 332 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.24 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  28.57 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  28.57 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 230 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.98 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  36.67 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  34.13 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  31.47 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  34.62 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  38.46 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  39.05 
 
 		 593 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.17 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  32.89 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  38.46 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  38.46 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  38.46 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  34.88 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  32.41 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  39.81 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.07 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>