More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1615 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  63.55 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  63.88 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  63 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  64.03 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  64.36 
 
 		 303 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  65.23 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  65.23 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  65.23 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  63.7 
 
 		 303 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  64.03 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  64.9 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  61.54 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  61.69 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  58.19 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 		 301 aa  353  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.68 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  37.44 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  35.54 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.82 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  29.32 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.23 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  37.22 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.7 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  39.73 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.25 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  37.21 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  31 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  28.57 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.36 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.86 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.01 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.38 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.1 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  38.24 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  39.13 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  34.91 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.02 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  32.51 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.97 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  37.98 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.24 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.24 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.34 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  35 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.85 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.34 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  32.85 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  34.78 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  34.63 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.74 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  34.78 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  33.96 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  38.14 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  38.76 
 
 		 1010 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  30.8 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  31.92 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  36.36 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.49 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  32.54 
 
 		 317 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 313 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  33.33 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  36.36 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  32.2 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.64 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  34.78 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  34.88 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  34.35 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  32.18 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  35.46 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  30.64 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  37.55 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  31.42 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  26.82 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.97 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35.61 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  34.78 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.6 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  38.46 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  37.02 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  35.27 
 
 		 373 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  37.02 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  26.25 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  31.8 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>