More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3049 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  100 
 
 		 330 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  49.54 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  49.38 
 
 		 325 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  48.73 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  47.34 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  47.17 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  45.51 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.01 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  46.08 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  46.08 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.08 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.79 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  46.04 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  43.67 
 
 		 333 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  43.67 
 
 		 333 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.79 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.79 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.79 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.49 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.41 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.79 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.41 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  43.79 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3434  Transketolase domain protein  49.68 
 
 		 353 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0193049  decreased coverage  0.00000789299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  44.67 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1056  transketolase domain-containing protein  45.31 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329928  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  44.03 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  44.44 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  44.84 
 
 		 340 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  44.84 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  44.54 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  44.11 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  44.97 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  40.61 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  42.55 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  41.85 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  41.54 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  43.2 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4080  Transketolase domain protein  44.11 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  42.41 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  43.58 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  47.27 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  43.65 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  42.24 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  43.26 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.34 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  44.68 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  43.03 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  46.69 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.79 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.55 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  44.25 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  41.61 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  42.6 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  46.88 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.2 
 
 		 497 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  44.14 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.48 
 
 		 467 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4318  Transketolase domain protein  45.2 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.87 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  44.28 
 
 		 347 aa  255  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  46.8 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.68 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  46.79 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  43.99 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.14 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  45.85 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  40.31 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  41.85 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.75 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.89 
 
 		 459 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  42.9 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  41.67 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.34 
 
 		 461 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  42.77 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  39.94 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  44.14 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.16 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  43.2 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  44.59 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.21 
 
 		 465 aa  249  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.17 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  45.02 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.48 
 
 		 465 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  43.89 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.17 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.9 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.77 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.81 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.81 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.68 
 
 		 451 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.19 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.55 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.45 
 
 		 464 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.4 
 
 		 454 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.44 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  42.9 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  43.38 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.1 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>