More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4402 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  100 
 
 		 320 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  75.24 
 
 		 321 aa  484  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  58.44 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  54.91 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  52.34 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  50.47 
 
 		 657 aa  328  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  53.27 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  51.66 
 
 		 659 aa  325  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  51.54 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  51.54 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  51.54 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  48.9 
 
 		 659 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.93 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  50.32 
 
 		 342 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  49.38 
 
 		 327 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  48.9 
 
 		 659 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  54.23 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  49.06 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50 
 
 		 328 aa  311  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  47.51 
 
 		 668 aa  310  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  50.94 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  48.3 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  48.3 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  45.7 
 
 		 658 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  47.2 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.28 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.23 
 
 		 327 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  48.76 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  48.92 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.23 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  49.23 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  49.23 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  46.75 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  50.62 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  46.75 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  51.19 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  49.06 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  48.1 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  48.1 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  48.29 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  48.76 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  48.11 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.54 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.89 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  45.65 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  47.35 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.78 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  46.86 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  48.77 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.83 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  45.03 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.78 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.43 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  47.08 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  46.75 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.58 
 
 		 328 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  46.79 
 
 		 337 aa  281  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  47.17 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  48.45 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  45.32 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  48.77 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  49.69 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.32 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  45.32 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  48.6 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  46.98 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  49.23 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.36 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  46.15 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  44.18 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.61 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.89 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.9 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  46.42 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  48.31 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.83 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  46.23 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  45.17 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  46.58 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.2 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  44.41 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.31 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.31 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  44.18 
 
 		 337 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  47.6 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.01 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  44.55 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  47.87 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>