More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4082 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  100 
 
 		 335 aa  663    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  46.63 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  47.69 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  48.77 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  48.01 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  47.8 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  47.99 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  49.84 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 328 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  47.08 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  46.15 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  46.98 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  47.38 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  47.66 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.48 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.28 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.18 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.3 
 
 		 331 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.96 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  43.65 
 
 		 325 aa  285  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  43.83 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  43.83 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.8 
 
 		 465 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  47.53 
 
 		 330 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.06 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.71 
 
 		 459 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  45.45 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.34 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  46.32 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.34 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.71 
 
 		 460 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  46.23 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  41.8 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  45.48 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  45.15 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  46.5 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  41.98 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.71 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  47.2 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.45 
 
 		 467 aa  271  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  45.51 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  46.6 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.65 
 
 		 469 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  47.21 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  45.78 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  44.01 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.68 
 
 		 331 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  44.48 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  45.09 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  42.59 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  47.44 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.51 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.79 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  44.62 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.79 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  43.71 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.79 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.11 
 
 		 449 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0509  transketolase, central region  46.03 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  47.69 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  38.7 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.48 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.17 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  41.77 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  43.52 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  42.9 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  43.52 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  45.08 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.17 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  43.24 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  48.22 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  46.44 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.56 
 
 		 483 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  44.31 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  44.31 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  44.31 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.2 
 
 		 482 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3317  transketolase central region  47.85 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  42.9 
 
 		 327 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  47.95 
 
 		 348 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.89 
 
 		 469 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.77 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.77 
 
 		 454 aa  261  8.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.65 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8973  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.98 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3701  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  49.04 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.86607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  41.99 
 
 		 791 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  40.56 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44.48 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.68 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  45.65 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  46.89 
 
 		 675 aa  259  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.4 
 
 		 463 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5078  Transketolase central region  47.76 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  41.67 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  44.14 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>