More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2096 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  100 
 
 
327 aa  659    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  69.42 
 
 
327 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  67.38 
 
 
328 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  63.61 
 
 
327 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  60.24 
 
 
327 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  63 
 
 
327 aa  417  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  60.24 
 
 
327 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  60.24 
 
 
327 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  60.24 
 
 
327 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  58.72 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  59.02 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  58.72 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  59.33 
 
 
327 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  61.11 
 
 
328 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  59.02 
 
 
327 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  59.02 
 
 
327 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  55.05 
 
 
324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  54.43 
 
 
324 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  54.43 
 
 
324 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  53.85 
 
 
327 aa  343  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  52.29 
 
 
324 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  52.32 
 
 
322 aa  334  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  53.09 
 
 
342 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  53.82 
 
 
343 aa  332  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  51.99 
 
 
330 aa  330  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  53.27 
 
 
320 aa  328  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  49.85 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  51.71 
 
 
335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  52.35 
 
 
328 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  53.29 
 
 
336 aa  323  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  51.08 
 
 
346 aa  323  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  50.15 
 
 
320 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  50.77 
 
 
325 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  51.42 
 
 
324 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  51.4 
 
 
332 aa  320  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  49.39 
 
 
325 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  49.1 
 
 
332 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.26 
 
 
337 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  49.41 
 
 
338 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.26 
 
 
337 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  51.09 
 
 
326 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  48.49 
 
 
332 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  49.24 
 
 
320 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.91 
 
 
320 aa  315  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  50.62 
 
 
325 aa  315  7e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  49.24 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  48.24 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  46.95 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  47.4 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  51.07 
 
 
320 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  48.62 
 
 
320 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  48.32 
 
 
657 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.7 
 
 
341 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  47.71 
 
 
325 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  51.99 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  48.62 
 
 
324 aa  309  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  48.32 
 
 
325 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  46.61 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  48.61 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  48.61 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1583  2-oxoisovalerate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  52.17 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  48.01 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  48.3 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  48.3 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  48.3 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.3 
 
 
325 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.71 
 
 
325 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  48.61 
 
 
325 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  48.77 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  48.77 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  48.3 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  48.3 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  48.3 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  48.3 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 
325 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  50 
 
 
320 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.3 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  48.93 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.48 
 
 
351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1926  transketolase, central region  47.87 
 
 
325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  48.46 
 
 
340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.61 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1787  transketolase, central region  49.09 
 
 
325 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  47.37 
 
 
325 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  48.3 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  48.62 
 
 
332 aa  301  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  46.95 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>