More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3767 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  100 
 
 
343 aa  695    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  58.44 
 
 
320 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  57.24 
 
 
657 aa  359  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  57.63 
 
 
321 aa  359  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  53.99 
 
 
328 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  53.82 
 
 
327 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50.46 
 
 
324 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.15 
 
 
324 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  52.45 
 
 
327 aa  328  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  49.85 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  49.85 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  52.45 
 
 
327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  48.35 
 
 
659 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  50.97 
 
 
342 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  46.32 
 
 
668 aa  319  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  44.98 
 
 
658 aa  312  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  51.66 
 
 
659 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  50.15 
 
 
332 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  46.71 
 
 
659 aa  308  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  48.46 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  48.46 
 
 
327 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  49.23 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  48.61 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  46.73 
 
 
342 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  48.46 
 
 
325 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  48.52 
 
 
336 aa  298  8e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  48.15 
 
 
325 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.2 
 
 
344 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.15 
 
 
327 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  48.15 
 
 
327 aa  295  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  46.79 
 
 
327 aa  295  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  46.6 
 
 
325 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  46.6 
 
 
325 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  49.22 
 
 
324 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  46.88 
 
 
324 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  47.84 
 
 
327 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  48.62 
 
 
327 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  47.81 
 
 
320 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  47.84 
 
 
327 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  48.62 
 
 
327 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  47.5 
 
 
320 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.38 
 
 
328 aa  292  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  45.68 
 
 
320 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  46.32 
 
 
328 aa  291  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.37 
 
 
325 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  46.6 
 
 
328 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.46 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.6 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.6 
 
 
325 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.02 
 
 
327 aa  288  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  48.92 
 
 
335 aa  289  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.02 
 
 
327 aa  288  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  46.6 
 
 
325 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  46.6 
 
 
325 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.91 
 
 
328 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  46.3 
 
 
325 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.44 
 
 
328 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  44.55 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  47.75 
 
 
330 aa  286  4e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  46.44 
 
 
324 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  45.99 
 
 
320 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  46.13 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.13 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  45.99 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  45.94 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  45.26 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  44.14 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  44.14 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  47.08 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  46.84 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  46.15 
 
 
325 aa  281  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  44.68 
 
 
332 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  45.86 
 
 
324 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  48.12 
 
 
325 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  45.54 
 
 
324 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.65 
 
 
331 aa  278  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.48 
 
 
337 aa  278  9e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.48 
 
 
337 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  43.83 
 
 
325 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  45.35 
 
 
339 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.72 
 
 
344 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  49.38 
 
 
323 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  45.77 
 
 
326 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  41.72 
 
 
344 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.72 
 
 
344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.72 
 
 
344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.72 
 
 
344 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>