More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0583 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  100 
 
 		 344 aa  696    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.99 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  62.99 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.99 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.99 
 
 		 344 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.69 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  62.69 
 
 		 344 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  62.39 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.39 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.09 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.69 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  63.47 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  64.35 
 
 		 342 aa  424  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  62.87 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  62.87 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  62.57 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  64.07 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  62.35 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  61.7 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  64.86 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  63.17 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  62.69 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  62.76 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  59.58 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  59.58 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  63.22 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  63.53 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  60.78 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  59.88 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  63.06 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  62.16 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  55.36 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  61.26 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  62.16 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  59.58 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  62.16 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  59.52 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  62.16 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  60.36 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  60.9 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  58.61 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  53.57 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  54.6 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  55.42 
 
 		 336 aa  345  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  52.57 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  52.57 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  51.66 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  53.33 
 
 		 320 aa  338  9e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  52.25 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  51.34 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  50.75 
 
 		 331 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  50.45 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  46.27 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  50.15 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  48.65 
 
 		 328 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  45.67 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  48.19 
 
 		 327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  48.65 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  48.99 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  47.35 
 
 		 347 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  46.27 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  47.49 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  47.45 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  48.84 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  47.2 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  45.27 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  45.61 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  47.15 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.89 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  44.78 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.89 
 
 		 469 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  44.48 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  48.95 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  43.88 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.29 
 
 		 448 aa  299  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  44.18 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.89 
 
 		 467 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.37 
 
 		 332 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.29 
 
 		 461 aa  298  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.29 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  47.45 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.99 
 
 		 497 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.89 
 
 		 465 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  48.35 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  47.01 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  50.87 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.39 
 
 		 467 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  49.7 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.81 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  44.88 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.22 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.29 
 
 		 459 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  47.79 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  45.59 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.8 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  47.32 
 
 		 791 aa  292  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.19 
 
 		 456 aa  292  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.69 
 
 		 449 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.39 
 
 		 465 aa  292  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.11 
 
 		 483 aa  291  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>