More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5165 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  100 
 
 		 326 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  81.6 
 
 		 326 aa  565  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  77.91 
 
 		 326 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  76 
 
 		 325 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  73.85 
 
 		 328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  67.79 
 
 		 327 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  69.54 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  69.23 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  68.31 
 
 		 325 aa  472  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  61.18 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.59 
 
 		 463 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.75 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.28 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.88 
 
 		 459 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.59 
 
 		 463 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.59 
 
 		 464 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.88 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.13 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.98 
 
 		 451 aa  401  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.28 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.36 
 
 		 483 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  57.85 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.36 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.75 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.76 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.46 
 
 		 461 aa  394  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.62 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.25 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.06 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.28 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.77 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.25 
 
 		 467 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.15 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.75 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.9 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.9 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.35 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.37 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.21 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.99 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.88 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.56 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.21 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.68 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.71 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.56 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.62 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.32 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  53.4 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.17 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  54.21 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  53.77 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.9 
 
 		 448 aa  368  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.91 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.75 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.29 
 
 		 461 aa  358  8e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  50.77 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  51.23 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.99 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  49.39 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.19 
 
 		 461 aa  345  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  48.29 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  48.93 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  50 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  49.85 
 
 		 327 aa  338  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  49.85 
 
 		 327 aa  338  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  48.64 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  49.69 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.77 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  51.24 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  52.13 
 
 		 375 aa  328  6e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  47.89 
 
 		 337 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  48.14 
 
 		 343 aa  320  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  47.99 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  47.55 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.6 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.62 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.3 
 
 		 328 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  44.69 
 
 		 322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  46.44 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  47.84 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  47.38 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  47.68 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  47.71 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  45.91 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  45.91 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  45.91 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  45.4 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  43.17 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  47.83 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  47.96 
 
 		 332 aa  301  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  47.63 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  46.13 
 
 		 327 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  45.06 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0386  transketolase  47.37 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  44.92 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  47.24 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  47.24 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>