More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1604 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  85.47 
 
 		 461 aa  776    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  71.64 
 
 		 469 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  83.26 
 
 		 461 aa  754    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70.87 
 
 		 483 aa  675    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  71.67 
 
 		 460 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  71.04 
 
 		 480 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  92.87 
 
 		 463 aa  829    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  85.16 
 
 		 465 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  83.37 
 
 		 465 aa  769    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  82.77 
 
 		 448 aa  727    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70.97 
 
 		 465 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  100 
 
 		 461 aa  930    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  69.44 
 
 		 463 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  69 
 
 		 497 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  68.76 
 
 		 451 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70.43 
 
 		 469 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  72.01 
 
 		 467 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  69.18 
 
 		 464 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70.75 
 
 		 465 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  71.64 
 
 		 469 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70.68 
 
 		 474 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  72.23 
 
 		 458 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70 
 
 		 464 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  71.31 
 
 		 480 aa  677    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  72.89 
 
 		 456 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  72.23 
 
 		 458 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  78.06 
 
 		 466 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  77.87 
 
 		 454 aa  730    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.88 
 
 		 467 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  69.44 
 
 		 463 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  70.99 
 
 		 482 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  73.48 
 
 		 459 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.89 
 
 		 456 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.09 
 
 		 466 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.94 
 
 		 456 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.37 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.39 
 
 		 456 aa  591  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.72 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.91 
 
 		 449 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.01 
 
 		 461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.19 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.72 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.24 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.53 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.44 
 
 		 332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  64.42 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.63 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  60.43 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  60.55 
 
 		 326 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  57.98 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  60.12 
 
 		 328 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  54.03 
 
 		 375 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  59.38 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  55.93 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  57.01 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  56.44 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  55.21 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  56.75 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  56.44 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  55.83 
 
 		 325 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  53.09 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  55.52 
 
 		 325 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  53.85 
 
 		 327 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  49.54 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.85 
 
 		 328 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  51.7 
 
 		 332 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  48.92 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  49.39 
 
 		 337 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  48.91 
 
 		 328 aa  316  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  48.41 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  48.76 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  48.6 
 
 		 328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  50 
 
 		 325 aa  312  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.91 
 
 		 328 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  49.54 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  48.63 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  45 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  45 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  45 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  46.73 
 
 		 327 aa  296  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  46.73 
 
 		 327 aa  296  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.77 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  44.65 
 
 		 322 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  44.97 
 
 		 322 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  46.42 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  43.96 
 
 		 327 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  44.65 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  48.76 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  47.38 
 
 		 327 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  44.9 
 
 		 327 aa  289  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  43.65 
 
 		 324 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  45.79 
 
 		 326 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  43.99 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  45.28 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  46.44 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  46.44 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  42.9 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  42.68 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  46.5 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  43.3 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>