More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2364 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  100 
 
 		 324 aa  651    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  60.06 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  55.52 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  55.36 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  54.93 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  55.52 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  54.93 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  55.22 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  55.22 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  56.88 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  54.93 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  56.88 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  55.52 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  55.22 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  55.22 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  55.72 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  55.72 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  55.72 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  52.71 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  53.01 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  56.76 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  55.49 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  54.49 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  51.81 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  52.69 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  51.81 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  51.81 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  53.66 
 
 		 334 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  57.99 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  52.71 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  55.89 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  52.4 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  49.85 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  53.73 
 
 		 337 aa  351  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  54.08 
 
 		 348 aa  350  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  51.36 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  50 
 
 		 328 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  53.75 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  50.76 
 
 		 348 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  52.58 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  50.77 
 
 		 350 aa  348  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  50.77 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  54.88 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.31 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  55.02 
 
 		 334 aa  345  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.55 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  51.23 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  51.25 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  54.57 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  53.66 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  52.11 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  53.96 
 
 		 334 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  51.38 
 
 		 325 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  48.92 
 
 		 326 aa  341  8e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  51.81 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  51.54 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  51.81 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  50.15 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  51.85 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  53.35 
 
 		 334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  49.54 
 
 		 325 aa  339  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  50.62 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  49.07 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  49.85 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  53.35 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  53.35 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  48.46 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  47.99 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  48.48 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  52.12 
 
 		 342 aa  335  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  50.93 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  52.32 
 
 		 332 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  49.85 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  50.9 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  51.71 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  47.53 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  49.39 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  47.68 
 
 		 325 aa  332  5e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  50.31 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  48.77 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  51.2 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.15 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  51.08 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.75 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  50.94 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.75 
 
 		 467 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.75 
 
 		 467 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.62 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  52.89 
 
 		 340 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  48.92 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  50.45 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  49.54 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  54.49 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  45.68 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.91 
 
 		 465 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  49.69 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.22 
 
 		 460 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  51.46 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  49.38 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  50.76 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>