More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2325 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  100 
 
 		 346 aa  698    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.5 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.5 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  62.5 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.2 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  62.5 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.5 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.2 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  62.2 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  61.61 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  62.2 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  54.6 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  54.6 
 
 		 334 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  52.06 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  53.68 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  53.68 
 
 		 333 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  52.06 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  52.06 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  52.06 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  53.75 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  53.07 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  54.15 
 
 		 342 aa  355  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  55.21 
 
 		 334 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  54.6 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  54.88 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  52.69 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  54.6 
 
 		 334 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  51.5 
 
 		 341 aa  349  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  54.29 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  53.99 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  52.45 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  53.68 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  53.07 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  53.37 
 
 		 334 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  53.37 
 
 		 334 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  54.13 
 
 		 337 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  51.1 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  52.74 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  50.45 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  51.84 
 
 		 340 aa  322  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  51.83 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  51.34 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  51.68 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  48.46 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.11 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.11 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  46.63 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  45.78 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  45.4 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  44.74 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  43.75 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.43 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  43.6 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  41.92 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  42.98 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  42.99 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  42.51 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  42.2 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  45.85 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  42.17 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  44.19 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  39.88 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  41.02 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44.01 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.98 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  41.16 
 
 		 325 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  43.92 
 
 		 347 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  44.04 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  43.03 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  42.07 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  42.68 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  45.29 
 
 		 340 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  40.84 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  43.79 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  43.47 
 
 		 675 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  40.61 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  40.12 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  42.51 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  42.51 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  42.51 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  39.29 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  41.41 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  38.99 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  42.18 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  40.36 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3449  Transketolase domain protein  43.11 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  43.55 
 
 		 346 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  42.34 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.34 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  40.8 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  41.27 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  41.35 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  42.04 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  42.04 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  41.69 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.62 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  40.31 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  39.66 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  44.31 
 
 		 324 aa  258  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  41.34 
 
 		 326 aa  258  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>