More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1776 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  98.8 
 
 		 334 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  100 
 
 		 334 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  95.81 
 
 		 334 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  96.11 
 
 		 334 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  96.41 
 
 		 334 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  96.11 
 
 		 334 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  95.81 
 
 		 334 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  89.82 
 
 		 334 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  90.39 
 
 		 334 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  87.09 
 
 		 334 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  78.12 
 
 		 339 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  77.34 
 
 		 339 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 		 340 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  75.83 
 
 		 340 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  75.83 
 
 		 340 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  78.12 
 
 		 339 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  73.49 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  71.43 
 
 		 339 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  74.4 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  71.99 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  71.99 
 
 		 335 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  73.27 
 
 		 340 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  68.69 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  68.69 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  70.52 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  67.16 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  69.72 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.84 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  60.3 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.84 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  62.39 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.24 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.54 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  59.94 
 
 		 344 aa  394  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  60.24 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  60.54 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.24 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  59.94 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.24 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  61.21 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  62.76 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  59.15 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  54.6 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  57.27 
 
 		 337 aa  351  8.999999999999999e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  53.66 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  50.76 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  50.76 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  51.53 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  50.88 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  47.87 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  47.87 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  47.56 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  47.04 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  48.18 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.05 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  43.64 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  48.3 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  45.54 
 
 		 324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  48.94 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  44.38 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  47.68 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  43.6 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  47.68 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  44.74 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.37 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  45.87 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  46.95 
 
 		 325 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  44.24 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  45.72 
 
 		 350 aa  285  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  47.66 
 
 		 348 aa  285  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  46.25 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  46.18 
 
 		 347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  45.32 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  46.85 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  46.04 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  49.7 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  46.61 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  43.6 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  45.13 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  47.13 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  46.27 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  47.42 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  43.6 
 
 		 327 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  44.71 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  44.07 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  48.31 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  48.79 
 
 		 675 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.15 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  45.37 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  46.04 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  46.79 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  46.85 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.95 
 
 		 461 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  42.38 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  47.77 
 
 		 348 aa  275  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.04 
 
 		 454 aa  275  9e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  44.68 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  45.51 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.79 
 
 		 467 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  45.12 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>