More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  100 
 
 		 348 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  84.97 
 
 		 348 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  78.9 
 
 		 347 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  74.93 
 
 		 341 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  65.37 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  66.57 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  58.43 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  63.69 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  62.97 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  56.48 
 
 		 350 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  55.86 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  52.29 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  50.76 
 
 		 324 aa  334  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  54.41 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  47.55 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  46.63 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  46.33 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.06 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.01 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.01 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  47.04 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  44.19 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  44.74 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  44.74 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  44.31 
 
 		 340 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  47.95 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.27 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  44.01 
 
 		 657 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  45.32 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  48.54 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  47.69 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  47.93 
 
 		 339 aa  282  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.2 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  45.18 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  47.19 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.24 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.84 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.84 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.84 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  46.77 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.84 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  48.07 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.54 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.54 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.54 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.05 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  43.6 
 
 		 346 aa  278  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.35 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.25 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.95 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  47.34 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.95 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.77 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.79 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  44.24 
 
 		 337 aa  276  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  46.61 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  46.31 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.77 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.77 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  46.6 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  46.2 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.52 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  46.31 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  46.31 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  46.31 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  47.48 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  46.61 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  45.72 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  46.46 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  46.54 
 
 		 343 aa  272  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.51 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.15 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  45.95 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  41.92 
 
 		 791 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  45.29 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  45.71 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  47.17 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  43.99 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.95 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.03 
 
 		 459 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  42.82 
 
 		 341 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  45.87 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.43 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.9 
 
 		 469 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  46.43 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  46.06 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  42.86 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  42.77 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  44.41 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.82 
 
 		 467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  40.84 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  46.57 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.56 
 
 		 461 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.56 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  47.27 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  43.2 
 
 		 326 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.45 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  41.14 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  44.75 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.41 
 
 		 465 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>