More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0912 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  100 
 
 		 341 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  74.93 
 
 		 348 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  75.38 
 
 		 348 aa  521  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  73.78 
 
 		 347 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  60.48 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  61.79 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  58.81 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  62.31 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  61.56 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  62.16 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  56.57 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  50.76 
 
 		 332 aa  335  9e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  49.85 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  50.59 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.86 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.86 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.49 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  44.19 
 
 		 339 aa  295  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  45.1 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.1 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  45.73 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  44.81 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.78 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  47.35 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  45.54 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  45.54 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.97 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  46.36 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.61 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  43.75 
 
 		 791 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  45.13 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.73 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  44.71 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  45.99 
 
 		 336 aa  278  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  45.54 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.9 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.9 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  43.58 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.6 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  43.65 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.54 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.6 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.31 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.31 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.31 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.18 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.31 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.59 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  45.21 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.31 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  45.59 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.44 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  44.94 
 
 		 342 aa  271  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  43.02 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  45.13 
 
 		 340 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  47.48 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  42.57 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  44.11 
 
 		 330 aa  268  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  43.47 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  43.7 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  43.29 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  45.72 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.17 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  43.6 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.17 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  44.41 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  45.29 
 
 		 334 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  43.07 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  43.47 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  43.03 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  44.48 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  44.48 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  45.94 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  45.72 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  45.43 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  45.43 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  45.43 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  41.62 
 
 		 657 aa  262  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.38 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  43.5 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  41.69 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  40.8 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  45.13 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  42.55 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  43.15 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  44.38 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.77 
 
 		 469 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  44.38 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.3 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.34 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.07 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  41.32 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  42.34 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  39.34 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.59 
 
 		 467 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  42.4 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  42.9 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.77 
 
 		 459 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.85 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>