More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5139 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  100 
 
 
334 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  95.81 
 
 
334 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  96.71 
 
 
334 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  97.6 
 
 
334 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  97.31 
 
 
334 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  97.31 
 
 
334 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  96.41 
 
 
334 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  91.62 
 
 
334 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  90.69 
 
 
334 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  87.09 
 
 
334 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  80.55 
 
 
339 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  79.46 
 
 
339 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  77.95 
 
 
340 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  77.95 
 
 
340 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  77.95 
 
 
340 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  80.24 
 
 
339 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  76.51 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  74.4 
 
 
337 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  75.38 
 
 
340 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  71.73 
 
 
339 aa  484  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  73.19 
 
 
340 aa  481  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  73.19 
 
 
335 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  69.3 
 
 
333 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  69.3 
 
 
333 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  71.78 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  70.95 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  68.06 
 
 
342 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  61.45 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  60.9 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  61.45 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  63.28 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.84 
 
 
344 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  61.14 
 
 
344 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.84 
 
 
344 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  60.84 
 
 
344 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  61.14 
 
 
344 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  60.54 
 
 
344 aa  401  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.84 
 
 
344 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  60.54 
 
 
344 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  61.52 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  62.16 
 
 
344 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  54.6 
 
 
346 aa  364  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  58.54 
 
 
336 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  58.18 
 
 
337 aa  358  9e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  53.66 
 
 
324 aa  350  2e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  51.96 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  51.96 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  51.23 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  47.56 
 
 
327 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  49.71 
 
 
346 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  45.15 
 
 
325 aa  298  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.95 
 
 
328 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  46.15 
 
 
324 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.65 
 
 
328 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.61 
 
 
348 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  45.15 
 
 
325 aa  292  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  47.88 
 
 
330 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.15 
 
 
328 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  44.68 
 
 
327 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.05 
 
 
330 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  48.94 
 
 
330 aa  290  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  47.26 
 
 
325 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  48.3 
 
 
320 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  46.02 
 
 
350 aa  288  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  46.9 
 
 
339 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  45.73 
 
 
328 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  45.26 
 
 
332 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  46.55 
 
 
328 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  45.43 
 
 
341 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  43.29 
 
 
325 aa  285  7e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  45.88 
 
 
347 aa  285  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  47.68 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  43.9 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  43.9 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  47.68 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  46.55 
 
 
342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  47.95 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  45.02 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.37 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  49.09 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  47.43 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.15 
 
 
331 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  47.42 
 
 
336 aa  281  8.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  45.96 
 
 
332 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  45.99 
 
 
327 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  44.41 
 
 
322 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  44.38 
 
 
328 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  48.37 
 
 
348 aa  279  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  45.9 
 
 
322 aa  279  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  47.77 
 
 
342 aa  279  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  45.73 
 
 
327 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  42.68 
 
 
326 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  45.43 
 
 
327 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  46.85 
 
 
328 aa  278  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>