More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2304 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  100 
 
 		 327 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  98.17 
 
 		 327 aa  656    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  89.6 
 
 		 327 aa  597  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  89.6 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  89.3 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  88.99 
 
 		 327 aa  594  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  67.58 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  67.58 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  66.67 
 
 		 327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  60.24 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  59.02 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  58.1 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  60.06 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  55.96 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  54.98 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  51.68 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.99 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  51.68 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  51.99 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  53.57 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  49.69 
 
 		 342 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  51.71 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  51.99 
 
 		 330 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  50 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  49.38 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  47.71 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 		 325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  48.45 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  49.69 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  51.23 
 
 		 324 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  48.77 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  48.92 
 
 		 325 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  50 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  48.16 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  47.55 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  48.5 
 
 		 332 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  49.38 
 
 		 320 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.07 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  48.15 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  47.49 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.07 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  48.32 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  49.67 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  49.67 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  50.31 
 
 		 340 aa  311  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  47.09 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  47.31 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.15 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  47.4 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  46.76 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  45.26 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  48.46 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  47.09 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  47.09 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  47.09 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.4 
 
 		 320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  48.6 
 
 		 325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  47.35 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  45.87 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.84 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  47.88 
 
 		 710 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  49.38 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  44.51 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  45.37 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  46.3 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  46.27 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  46.3 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.65 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  46.04 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  47.2 
 
 		 320 aa  298  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  46.89 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  46.04 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  47.2 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  46.89 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  45.37 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  45.96 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1936  transketolase, central region  45.73 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.4 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  47.08 
 
 		 332 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  47.24 
 
 		 659 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  46.48 
 
 		 657 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1583  2-oxoisovalerate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.2 
 
 		 325 aa  295  9e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  44.14 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  46.93 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  46.44 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>