More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0991 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 710 aa  1455    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  44.38 
 
 		 736 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  47.98 
 
 		 678 aa  567  1e-160  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  41.36 
 
 		 709 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  36.71 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  40.34 
 
 		 657 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  37.54 
 
 		 692 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  36.09 
 
 		 659 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  38.92 
 
 		 693 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  35.67 
 
 		 701 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  36.39 
 
 		 668 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  36.13 
 
 		 659 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.66 
 
 		 702 aa  365  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  35.09 
 
 		 658 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  34.83 
 
 		 681 aa  359  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  34.9 
 
 		 692 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  33.43 
 
 		 659 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  36.38 
 
 		 675 aa  340  5.9999999999999996e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  51.53 
 
 		 327 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  50.92 
 
 		 328 aa  327  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  34.1 
 
 		 791 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  50.91 
 
 		 327 aa  318  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  47.88 
 
 		 327 aa  317  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  47.88 
 
 		 327 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  49.85 
 
 		 330 aa  312  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  50.3 
 
 		 327 aa  312  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  49.39 
 
 		 327 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4204  transketolase central region  33.19 
 
 		 694 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  50.46 
 
 		 324 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  50.46 
 
 		 324 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.46 
 
 		 324 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.31 
 
 		 327 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48.31 
 
 		 327 aa  300  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  50.46 
 
 		 325 aa  300  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  48.31 
 
 		 327 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  48.02 
 
 		 324 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  48 
 
 		 327 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  48 
 
 		 327 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  48.62 
 
 		 320 aa  296  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.87 
 
 		 325 aa  294  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.84 
 
 		 341 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2591  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (2-methylpropanoyl-transferring)  48.44 
 
 		 324 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  46.63 
 
 		 326 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  33.13 
 
 		 680 aa  287  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  46.48 
 
 		 325 aa  286  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  49.07 
 
 		 320 aa  286  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  47.62 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  44.38 
 
 		 346 aa  286  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  48.47 
 
 		 325 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  44.65 
 
 		 325 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.87 
 
 		 325 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  44.65 
 
 		 325 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  45.13 
 
 		 337 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  46.98 
 
 		 332 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  44.31 
 
 		 327 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  47.85 
 
 		 322 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.57 
 
 		 325 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  44.31 
 
 		 327 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  45.57 
 
 		 325 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  31.83 
 
 		 727 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.25 
 
 		 337 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  44.95 
 
 		 325 aa  283  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.25 
 
 		 337 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  46.69 
 
 		 337 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  48.55 
 
 		 325 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  46.36 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  46.36 
 
 		 333 aa  282  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  46.48 
 
 		 325 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  45.57 
 
 		 325 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  46.93 
 
 		 325 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  46.93 
 
 		 325 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  47.35 
 
 		 325 aa  279  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  46.93 
 
 		 325 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  46.93 
 
 		 325 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  34.63 
 
 		 666 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  46.63 
 
 		 325 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  46.01 
 
 		 325 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  46.01 
 
 		 325 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  46.01 
 
 		 325 aa  276  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  43.69 
 
 		 324 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  33.16 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  44.82 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  47.42 
 
 		 324 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1583  2-oxoisovalerate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.36 
 
 		 325 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  45.57 
 
 		 327 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.46 
 
 		 328 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  46.32 
 
 		 325 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1956  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.73 
 
 		 721 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>