More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1549 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  100 
 
 		 709 aa  1424    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  62.99 
 
 		 692 aa  853    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  58.33 
 
 		 701 aa  845    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  60.89 
 
 		 692 aa  834    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  62.48 
 
 		 693 aa  812    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  37.48 
 
 		 736 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  41.45 
 
 		 710 aa  399  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  35.34 
 
 		 678 aa  318  2e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  34.3 
 
 		 657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  36.19 
 
 		 702 aa  296  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.51 
 
 		 688 aa  291  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  47.71 
 
 		 330 aa  278  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  29.62 
 
 		 659 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.95 
 
 		 324 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  28.99 
 
 		 658 aa  270  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  46.91 
 
 		 322 aa  269  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  43.38 
 
 		 328 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  45.37 
 
 		 338 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  29.64 
 
 		 668 aa  264  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  44.65 
 
 		 324 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  44.65 
 
 		 324 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.34 
 
 		 324 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  29.61 
 
 		 659 aa  260  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.78 
 
 		 351 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  30.8 
 
 		 681 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  46.6 
 
 		 332 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  42.68 
 
 		 327 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  48.45 
 
 		 325 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  46.77 
 
 		 327 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  47.38 
 
 		 327 aa  255  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  30.53 
 
 		 659 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  45.95 
 
 		 332 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  43.65 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.23 
 
 		 337 aa  251  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.59 
 
 		 337 aa  250  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  43.45 
 
 		 341 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  44.9 
 
 		 337 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  43.52 
 
 		 325 aa  249  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  43.56 
 
 		 346 aa  249  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  43.91 
 
 		 337 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  31.47 
 
 		 675 aa  248  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  41.46 
 
 		 327 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  40.85 
 
 		 327 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  41.94 
 
 		 345 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  43.47 
 
 		 342 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  41.79 
 
 		 337 aa  244  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  42.33 
 
 		 325 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  42.33 
 
 		 325 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  42.33 
 
 		 325 aa  244  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  40.67 
 
 		 343 aa  244  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  42.2 
 
 		 325 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  42.15 
 
 		 324 aa  243  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  43.41 
 
 		 343 aa  243  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  43.96 
 
 		 320 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  42.2 
 
 		 325 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  41.85 
 
 		 324 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  42.2 
 
 		 325 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  42.2 
 
 		 325 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  42.2 
 
 		 325 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  45.06 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  41.9 
 
 		 325 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  41.59 
 
 		 325 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.59 
 
 		 347 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  43.91 
 
 		 336 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  32.06 
 
 		 791 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  41.72 
 
 		 325 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.34 
 
 		 346 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2993  2-oxoisovalerate dehydrogenase (beta subunit)  43.13 
 
 		 350 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  42.2 
 
 		 325 aa  241  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35520  2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta  43.13 
 
 		 350 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0580998  hitchhiker  0.00209483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  41.72 
 
 		 327 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2328  transketolase, central region  41.28 
 
 		 325 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  39.57 
 
 		 327 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  45.33 
 
 		 340 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  42.6 
 
 		 347 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.63 
 
 		 337 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  42.6 
 
 		 347 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  41.8 
 
 		 339 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  42.51 
 
 		 320 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  43.75 
 
 		 320 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  41.74 
 
 		 346 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  41.74 
 
 		 346 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  41.74 
 
 		 346 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  42.41 
 
 		 335 aa  238  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  41.46 
 
 		 336 aa  237  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1936  transketolase, central region  41.28 
 
 		 325 aa  236  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  41.09 
 
 		 337 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  42.06 
 
 		 347 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3963  transketolase central region  41.88 
 
 		 352 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  41.88 
 
 		 352 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.49 
 
 		 347 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.49 
 
 		 347 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.49 
 
 		 347 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  42.49 
 
 		 347 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  40.37 
 
 		 325 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.49 
 
 		 347 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.49 
 
 		 334 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.58 
 
 		 352 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  40.67 
 
 		 325 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  31.92 
 
 		 617 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>