More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1851 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  100 
 
 		 335 aa  669    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  86.75 
 
 		 332 aa  588  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  70.12 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  56.92 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  57.14 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  56.83 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  54.83 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  56.52 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  53.42 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  54.97 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  53.37 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  57.19 
 
 		 325 aa  361  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  54.63 
 
 		 324 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.97 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.66 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  54.35 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.35 
 
 		 325 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  52.78 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  56.48 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  52.78 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  53.87 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  54.43 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  53.58 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  54.18 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.78 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  53.35 
 
 		 346 aa  351  8e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  51.54 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.84 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.65 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  51.23 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  53.58 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  52.52 
 
 		 338 aa  341  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  53.25 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  51.85 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  52.96 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.02 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  52.34 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  53.85 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  51.41 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  51.09 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  51.09 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  50 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  51.4 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.45 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.55 
 
 		 337 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.18 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  50.45 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.55 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.55 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  50.31 
 
 		 326 aa  328  6e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  49.53 
 
 		 324 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  54.66 
 
 		 323 aa  328  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  50.75 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  48.59 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  48.59 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0738  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  53.09 
 
 		 326 aa  328  9e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  48.59 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  49.22 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  49.22 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  48.9 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  48.9 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  53.58 
 
 		 326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  48.9 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  50.47 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  48.9 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  49.55 
 
 		 337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  50.15 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  46.8 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  51.71 
 
 		 327 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  48.77 
 
 		 325 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  49.22 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0050  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.31 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  51.24 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  49.85 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  50.93 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.96 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  50.62 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.96 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  48.82 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.66 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  47.96 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  46.44 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  48.82 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2993  2-oxoisovalerate dehydrogenase (beta subunit)  46.46 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  47.8 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35520  2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta  46.46 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0580998  hitchhiker  0.00209483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  48.75 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  45.2 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  53.89 
 
 		 326 aa  318  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  47.04 
 
 		 337 aa  318  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.7 
 
 		 352 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2328  transketolase, central region  46.75 
 
 		 325 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0632  transketolase domain-containing protein  50.62 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3743  transketolase central region  49.1 
 
 		 352 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.530888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>