More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0826 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  100 
 
 
327 aa  657    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  58.9 
 
 
346 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  60 
 
 
331 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  59.75 
 
 
342 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  60.37 
 
 
336 aa  397  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  59.44 
 
 
320 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  58.28 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  59.13 
 
 
320 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  58.26 
 
 
320 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  58.2 
 
 
320 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  57.89 
 
 
324 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  58.51 
 
 
324 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  56.83 
 
 
325 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  57.89 
 
 
324 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  57.28 
 
 
324 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  58.13 
 
 
325 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  59.94 
 
 
332 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  55.42 
 
 
326 aa  378  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  57.36 
 
 
327 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  54.95 
 
 
326 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  56.92 
 
 
335 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  58.15 
 
 
320 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  53.56 
 
 
325 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  57.59 
 
 
320 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.94 
 
 
325 aa  363  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  53.56 
 
 
325 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.94 
 
 
325 aa  362  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  52.63 
 
 
325 aa  361  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  52.63 
 
 
325 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  52.94 
 
 
325 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  54.74 
 
 
326 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  52.32 
 
 
325 aa  352  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  52.32 
 
 
325 aa  352  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  52.62 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  51.99 
 
 
325 aa  352  7e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  53.27 
 
 
326 aa  348  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  55.17 
 
 
328 aa  347  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  50.32 
 
 
324 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.96 
 
 
341 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  51.39 
 
 
326 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  52.34 
 
 
326 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  50 
 
 
324 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  53.85 
 
 
327 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  54.63 
 
 
330 aa  340  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  52.01 
 
 
326 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  50.31 
 
 
325 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  48.92 
 
 
326 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  48.92 
 
 
326 aa  338  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.55 
 
 
351 aa  338  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  53.04 
 
 
326 aa  338  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  52.8 
 
 
327 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.45 
 
 
337 aa  335  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  51.86 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  48.82 
 
 
343 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  53.27 
 
 
326 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  50.46 
 
 
326 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  49.7 
 
 
325 aa  330  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  50.45 
 
 
332 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  50.62 
 
 
323 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  52.17 
 
 
322 aa  329  3e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  53.82 
 
 
334 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  49.85 
 
 
334 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  49.08 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  50.15 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  48.07 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  49.39 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  50.31 
 
 
328 aa  325  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  49.56 
 
 
338 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  49.55 
 
 
332 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  48.66 
 
 
345 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  51.46 
 
 
325 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  48.48 
 
 
325 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0632  transketolase domain-containing protein  49.69 
 
 
325 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  48.77 
 
 
325 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  48.46 
 
 
325 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  48.46 
 
 
325 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  48.46 
 
 
325 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  48.46 
 
 
325 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  48.15 
 
 
325 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  48.15 
 
 
325 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  48.15 
 
 
325 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1583  2-oxoisovalerate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.15 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2328  transketolase, central region  48.77 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  47.26 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  48.77 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.46 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  47.22 
 
 
325 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1936  transketolase, central region  47.84 
 
 
325 aa  319  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208007  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.65 
 
 
337 aa  318  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.65 
 
 
337 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.53 
 
 
325 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.94 
 
 
346 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  48.65 
 
 
337 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  48.63 
 
 
346 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>