More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1956 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1956  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 721 aa  1444    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2640  Transketolase domain protein  50.79 
 
 		 759 aa  648    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3370  transketolase domain-containing protein  51.52 
 
 		 792 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1035  transketolase central region  45.06 
 
 		 747 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6420  2-oxoisovalerate dehydrogenase  60 
 
 		 736 aa  839    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3017  transketolase, central region  47.41 
 
 		 761 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3610  transketolase domain-containing protein  52.07 
 
 		 805 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2022  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  98.61 
 
 		 721 aa  1422    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2156  transketolase central region  64 
 
 		 790 aa  861    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1976  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  98.4 
 
 		 687 aa  1354    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611209  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2727  transketolase, central region  49.17 
 
 		 727 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0901  transketolase, central region  45.68 
 
 		 763 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.542357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2962  transketolase, central region  48.84 
 
 		 733 aa  627  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0290304  normal  0.0965541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2795  transketolase, central region  47.88 
 
 		 761 aa  628  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2954  transketolase, central region  48.64 
 
 		 727 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.998903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2633  hypothetical protein  44.99 
 
 		 745 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1294  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.9 
 
 		 727 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1045  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.37 
 
 		 738 aa  618  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2503  hypothetical protein  44.99 
 
 		 745 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2566  putative bifunctional enzyme  49.28 
 
 		 743 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104347  hitchhiker  0.000000000000144647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3884  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.5 
 
 		 735 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  31.73 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  28.46 
 
 		 736 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  28.79 
 
 		 678 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  31.78 
 
 		 692 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  29.36 
 
 		 709 aa  193  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  29.49 
 
 		 701 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  32.32 
 
 		 666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  32.89 
 
 		 693 aa  184  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  28.11 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  26.17 
 
 		 688 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  24.96 
 
 		 668 aa  173  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  30.31 
 
 		 680 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  33.55 
 
 		 322 aa  170  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  25.91 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  33.55 
 
 		 328 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  34.92 
 
 		 325 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  32.94 
 
 		 325 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  33.54 
 
 		 324 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  24.45 
 
 		 659 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  28.02 
 
 		 657 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  33.23 
 
 		 324 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  29.4 
 
 		 617 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2652  Transketolase domain protein  25.92 
 
 		 730 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.815097  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.38 
 
 		 325 aa  162  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  34.02 
 
 		 327 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  32.34 
 
 		 325 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  33.55 
 
 		 320 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  33.86 
 
 		 325 aa  161  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  34.9 
 
 		 327 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  24.78 
 
 		 659 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  25.72 
 
 		 791 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  33.33 
 
 		 348 aa  158  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  31.16 
 
 		 325 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  31.16 
 
 		 325 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 347 aa  157  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.54 
 
 		 346 aa  157  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 347 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 347 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 347 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 347 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  32.93 
 
 		 346 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 347 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  31.34 
 
 		 327 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  32.93 
 
 		 346 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  34.64 
 
 		 320 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  33.87 
 
 		 327 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  32.93 
 
 		 346 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  33.02 
 
 		 326 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  32.19 
 
 		 341 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  32.14 
 
 		 327 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  31.11 
 
 		 327 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  32.54 
 
 		 339 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  33.02 
 
 		 354 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  32.93 
 
 		 347 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  24.56 
 
 		 659 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  31.82 
 
 		 327 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2993  2-oxoisovalerate dehydrogenase (beta subunit)  31.9 
 
 		 350 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.06 
 
 		 337 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.44 
 
 		 336 aa  153  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35520  2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta  31.9 
 
 		 350 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0580998  hitchhiker  0.00209483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  33.13 
 
 		 337 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  33.13 
 
 		 347 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 334 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  33.83 
 
 		 326 aa  153  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  30.97 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.07 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  33.13 
 
 		 347 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  34.29 
 
 		 320 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0050  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  30.79 
 
 		 326 aa  152  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.56 
 
 		 325 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  32.21 
 
 		 326 aa  152  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.07 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  26.14 
 
 		 681 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>