More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2062 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  100 
 
 		 327 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  78.09 
 
 		 325 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  52.17 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  52.17 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.76 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  53.27 
 
 		 320 aa  331  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  48.93 
 
 		 328 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  49.07 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  48.61 
 
 		 332 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  47.17 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  49.69 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  48.15 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3701  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  51.12 
 
 		 337 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.86607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  47.84 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.23 
 
 		 465 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  49.38 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.53 
 
 		 459 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.62 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  47.84 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.79 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.48 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  48.63 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.6 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  47.53 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  48.19 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  47.92 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.69 
 
 		 448 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  49.7 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  48.04 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  48.33 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.39 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  47.53 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.55 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  48.02 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  45.14 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.55 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.25 
 
 		 344 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  46.25 
 
 		 344 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  46.25 
 
 		 344 aa  301  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  49.85 
 
 		 328 aa  301  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.25 
 
 		 344 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.31 
 
 		 337 aa  301  9e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.25 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.25 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  45.06 
 
 		 326 aa  300  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.25 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.77 
 
 		 465 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  51.6 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  45.95 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  47.87 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  47.26 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  46.95 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.85 
 
 		 454 aa  299  5e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  46.53 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  46.53 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  48.6 
 
 		 325 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  48.94 
 
 		 339 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  49.06 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  48.73 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  46.34 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  46.15 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.31 
 
 		 469 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.68 
 
 		 460 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.98 
 
 		 467 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.08 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  47.08 
 
 		 322 aa  292  7e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.22 
 
 		 449 aa  291  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  46.18 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.23 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  47.22 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.24 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  45.35 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  46.34 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.09 
 
 		 465 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  48.17 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.38 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.15 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  46.11 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.08 
 
 		 463 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.32 
 
 		 482 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  48.29 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.71 
 
 		 483 aa  288  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.15 
 
 		 465 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.42 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  46.27 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  47.56 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.01 
 
 		 469 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  47.16 
 
 		 346 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  47.87 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  47.71 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  47.68 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  43.16 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  46.95 
 
 		 334 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  47.56 
 
 		 334 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.42 
 
 		 337 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  46.44 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  47.26 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  46.73 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  47.56 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>