More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0347 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  100 
 
 		 334 aa  675    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  68.92 
 
 		 330 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  66.97 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  50 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  48.11 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  47.48 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  45.14 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  49.52 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  46.3 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  46.01 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  45.45 
 
 		 328 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.51 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  45.91 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.15 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  45.6 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  46.23 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  43.57 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  43.57 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  47.83 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  42.95 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  43.81 
 
 		 333 aa  272  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3317  transketolase central region  48.09 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  43.5 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  45.06 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  44.94 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  42.99 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  46.58 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  44.34 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  45.31 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  43.38 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  43.53 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  43.57 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  41.99 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  44.31 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  41.69 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  47.42 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  41.28 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  41.69 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4721  transketolase central region  48.15 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  40.98 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.2 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  41.41 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  44.88 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  45.54 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  45.34 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  43.89 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  40.88 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  45.34 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  45.34 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.98 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.98 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  40.98 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.84 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  42.02 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.93 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.98 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  44.89 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  44.89 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.98 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.74 
 
 		 467 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.98 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.94 
 
 		 459 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  42.01 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  45.43 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  41.93 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.67 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  43.24 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  45.89 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.27 
 
 		 324 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  43.08 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  42.06 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.67 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  43.6 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  42.51 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  41.61 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.38 
 
 		 460 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3932  Transketolase central region  46.55 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  41.69 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  42.94 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  43.83 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  40.57 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  43.4 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  41.54 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.61 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  43.67 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  43.56 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  42.55 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  44.71 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1409  transketolase, central region  45.2 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.44 
 
 		 325 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  42.01 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  45.39 
 
 		 320 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  44.44 
 
 		 346 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  41.81 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.34 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  43.93 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  44.41 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  45.03 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  44.06 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>