More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3707 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  100 
 
 		 327 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.04 
 
 		 459 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  60.31 
 
 		 325 aa  407  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  60 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  58.77 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  59.82 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.96 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.96 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  60.92 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  58.15 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  59.33 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.94 
 
 		 460 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  57.85 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.87 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.74 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.38 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.8 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.43 
 
 		 469 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  59.02 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.43 
 
 		 483 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.25 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.56 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.28 
 
 		 454 aa  394  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.51 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.82 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.28 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.9 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.69 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.98 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.01 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  57.67 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.59 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  57.01 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.98 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.19 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.88 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.36 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.36 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.43 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.95 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.69 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.9 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  57.19 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.98 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.43 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.06 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.44 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.36 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.9 
 
 		 461 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.06 
 
 		 332 aa  371  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.52 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.57 
 
 		 448 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.13 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  53.05 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  54.77 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  52.44 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.77 
 
 		 466 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  52 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.13 
 
 		 454 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  51.39 
 
 		 330 aa  348  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  52.92 
 
 		 328 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  52.5 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  54.01 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  52.16 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  50.62 
 
 		 331 aa  341  9e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  52.31 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  52 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  51.82 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  53.54 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  50.93 
 
 		 322 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  53.7 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  53.09 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  50.62 
 
 		 322 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  51.22 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  52.58 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  53.44 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  51.23 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.04 
 
 		 461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  49.23 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  49.23 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  50 
 
 		 326 aa  311  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  48.6 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  51.72 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3602  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  48.15 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  48.47 
 
 		 327 aa  309  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  47.4 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  47.55 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  47.53 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  47.24 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  49.7 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  47.84 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  47.84 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  47.52 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  50 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  47.2 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  45.65 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1190  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.82 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>