More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13273 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  100 
 
 		 325 aa  666    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  84 
 
 		 325 aa  575  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  83.69 
 
 		 325 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  70.77 
 
 		 326 aa  487  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  68.92 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  70.46 
 
 		 328 aa  481  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  70.25 
 
 		 326 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  68.31 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  68.52 
 
 		 327 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  62.15 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  60.92 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.76 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 464 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.06 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.06 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.97 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.13 
 
 		 469 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.02 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.06 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.69 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.83 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.75 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.39 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.39 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.13 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.94 
 
 		 458 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.08 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.6 
 
 		 465 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.32 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.94 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.83 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.29 
 
 		 482 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.68 
 
 		 480 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.46 
 
 		 461 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.68 
 
 		 465 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.46 
 
 		 448 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.82 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.37 
 
 		 497 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.99 
 
 		 469 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.99 
 
 		 483 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.75 
 
 		 456 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.75 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  53.4 
 
 		 325 aa  359  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  50.63 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.37 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.97 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  50 
 
 		 332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.85 
 
 		 465 aa  354  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  52.92 
 
 		 460 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55 
 
 		 466 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  52.81 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.49 
 
 		 466 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.29 
 
 		 458 aa  348  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.82 
 
 		 332 aa  348  9e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.07 
 
 		 454 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  52.45 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.29 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  52.45 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.68 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  51.39 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  50 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.68 
 
 		 466 aa  338  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  50.47 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.07 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  49.7 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  47.24 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  48.44 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  47.53 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  50.15 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  47.22 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.6 
 
 		 461 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  47.87 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.91 
 
 		 331 aa  322  7e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  46.75 
 
 		 322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  46.75 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  46.5 
 
 		 337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.92 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  48.15 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  46.08 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  46.58 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  45.87 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  45.51 
 
 		 327 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.91 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  47.53 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  46.04 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  43.12 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  43.12 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  43.12 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  44.01 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  43.34 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  42.11 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1409  transketolase, central region  46.03 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  42.15 
 
 		 327 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  43.17 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  45.2 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.03 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  43.67 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  43.34 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  44.55 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>