More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20183 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  100 
 
 		 360 aa  740    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  62.08 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.6 
 
 		 468 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  60.06 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  63.27 
 
 		 375 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.02 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.28 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.41 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.75 
 
 		 497 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.59 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.66 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.24 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.36 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  59.27 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.02 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.62 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.76 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.14 
 
 		 456 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.62 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.93 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.93 
 
 		 448 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.71 
 
 		 456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.2 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.05 
 
 		 466 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.61 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.23 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.75 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.62 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.75 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.45 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.7 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.67 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.4 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.1 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.93 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.93 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.84 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.77 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.93 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.53 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.1 
 
 		 466 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.61 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.93 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.84 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.08 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.66 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.41 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.91 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  55.35 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.68 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.5 
 
 		 461 aa  357  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  52.44 
 
 		 327 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  50.91 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  50.94 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  48.64 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  49.24 
 
 		 326 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  48.01 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  48.62 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  46.81 
 
 		 326 aa  332  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  48.48 
 
 		 327 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  49.7 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  48.62 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  50.92 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.39 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  46.44 
 
 		 332 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  47.85 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.54 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  44.72 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.85 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  46.63 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  45.28 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  48.24 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  45.37 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  47 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  45.65 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  44.27 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.53 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  44.44 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  44.65 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  44.97 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  44.48 
 
 		 324 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3467  Transketolase central region  46.2 
 
 		 335 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.538791  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  44.75 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.34 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44.92 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  43.52 
 
 		 322 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.67 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.86 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  42.72 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  42.77 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  42.9 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.65 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  43.52 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.51 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  42.55 
 
 		 328 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  44.17 
 
 		 324 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.32 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  44.62 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  43.79 
 
 		 327 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.16 
 
 		 327 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>