More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_09403 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  100 
 
 
375 aa  771    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  70.48 
 
 
389 aa  479  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  60.53 
 
 
394 aa  449  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.41 
 
 
448 aa  424  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  63.27 
 
 
360 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.89 
 
 
449 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.18 
 
 
460 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.55 
 
 
483 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.37 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.67 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.04 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.42 
 
 
468 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.37 
 
 
469 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.66 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.41 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.37 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.68 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.86 
 
 
465 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.23 
 
 
465 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.99 
 
 
469 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.61 
 
 
474 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.94 
 
 
463 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  59.88 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.49 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.25 
 
 
466 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.86 
 
 
458 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.57 
 
 
467 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.9 
 
 
451 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.75 
 
 
461 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.58 
 
 
448 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.33 
 
 
456 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.45 
 
 
465 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.26 
 
 
461 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.79 
 
 
466 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.62 
 
 
465 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.93 
 
 
332 aa  388  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.23 
 
 
454 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.02 
 
 
332 aa  388  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.23 
 
 
469 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.97 
 
 
332 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.12 
 
 
454 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.46 
 
 
464 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.36 
 
 
456 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  56.51 
 
 
463 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.54 
 
 
463 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  57.19 
 
 
464 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  58.04 
 
 
458 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.78 
 
 
332 aa  369  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.44 
 
 
461 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  60.71 
 
 
466 aa  362  6e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  61.44 
 
 
461 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  50.46 
 
 
328 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  49.24 
 
 
325 aa  334  1e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  51.22 
 
 
327 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  51.48 
 
 
326 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  50.62 
 
 
324 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  51.8 
 
 
326 aa  328  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  52.13 
 
 
326 aa  328  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  51.88 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  50 
 
 
328 aa  322  5e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  47.4 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  48.45 
 
 
327 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  46.32 
 
 
332 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  45.87 
 
 
325 aa  306  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.71 
 
 
330 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  44.65 
 
 
325 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  44.31 
 
 
325 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.91 
 
 
331 aa  291  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  46.18 
 
 
343 aa  289  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  45.45 
 
 
328 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  45.95 
 
 
332 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.54 
 
 
328 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  46.01 
 
 
328 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  44.27 
 
 
332 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  41.85 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  41.85 
 
 
322 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  44.2 
 
 
337 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  43.87 
 
 
328 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  44.17 
 
 
328 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  42.64 
 
 
327 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  43.73 
 
 
324 aa  264  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  42.02 
 
 
324 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  39.76 
 
 
327 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  41.46 
 
 
327 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  42.5 
 
 
327 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  41.46 
 
 
327 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  43.25 
 
 
326 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  42.5 
 
 
327 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  44.16 
 
 
356 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3602  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  41.41 
 
 
334 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  42.43 
 
 
342 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  40.67 
 
 
325 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  40.98 
 
 
324 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  40.67 
 
 
325 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  40.67 
 
 
325 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  42.11 
 
 
327 aa  255  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  41.74 
 
 
327 aa  255  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  42.86 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  43.54 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.25 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>