More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3602 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3602  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  100 
 
 		 334 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  66.98 
 
 		 327 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  61.56 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  61.56 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  61.56 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1409  transketolase, central region  64.4 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  61.37 
 
 		 324 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  63.27 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  63.19 
 
 		 669 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0509  transketolase, central region  63.64 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3467  Transketolase central region  62.62 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.538791  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0386  transketolase  64.91 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  62.93 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  64.11 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  61.25 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  64.11 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1414  Transketolase central region  63.86 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.713226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  60.06 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  50.94 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.21 
 
 		 467 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  48.15 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  47.22 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.98 
 
 		 469 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.34 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  47.37 
 
 		 322 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  48.01 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  47.37 
 
 		 332 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  46.6 
 
 		 332 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  46.75 
 
 		 322 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  44.89 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  46.44 
 
 		 327 aa  311  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.11 
 
 		 465 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.06 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  46.81 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  47.81 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.44 
 
 		 464 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.02 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.04 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  45.25 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  45.51 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  44.58 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.48 
 
 		 480 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.23 
 
 		 465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.51 
 
 		 463 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.99 
 
 		 463 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.48 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  45.51 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.57 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.61 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.45 
 
 		 468 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.99 
 
 		 461 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.89 
 
 		 482 aa  301  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.99 
 
 		 448 aa  301  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.27 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.79 
 
 		 467 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.55 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.58 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.13 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.03 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.98 
 
 		 469 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  45.17 
 
 		 327 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.2 
 
 		 480 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.29 
 
 		 332 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.61 
 
 		 454 aa  298  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.65 
 
 		 325 aa  298  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.68 
 
 		 465 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.46 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.96 
 
 		 448 aa  295  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.6 
 
 		 454 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  44.58 
 
 		 327 aa  295  9e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  41.8 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.24 
 
 		 456 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.59 
 
 		 456 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  43.21 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  44.27 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.83 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.79 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.09 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  43.96 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  43.03 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.57 
 
 		 458 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.6 
 
 		 451 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.43 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  45.96 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.37 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.82 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.2 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.12 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  42.72 
 
 		 327 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  46.46 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.17 
 
 		 458 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  42.09 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  42.72 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  44.44 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.72 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  41.98 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  41.8 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.59 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  43.52 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.52 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>