More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2596 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  100 
 
 		 669 aa  1357    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  40.82 
 
 		 675 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  67.7 
 
 		 324 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  65.94 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  63.58 
 
 		 327 aa  436  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  65.94 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  65.94 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  64.72 
 
 		 333 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0509  transketolase, central region  66.98 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  69.44 
 
 		 330 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1409  transketolase, central region  67.18 
 
 		 325 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3602  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  63.19 
 
 		 334 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  68.83 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  66.56 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  68.83 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0386  transketolase  69.54 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  67.6 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3467  Transketolase central region  65.42 
 
 		 335 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.538791  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  39.44 
 
 		 657 aa  399  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0510  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  60.54 
 
 		 333 aa  392  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2175  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  56.57 
 
 		 331 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1609  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  57.78 
 
 		 332 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.127409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1414  Transketolase central region  67.08 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.713226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3601  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  57.98 
 
 		 329 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4645  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  61.2 
 
 		 341 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1108  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  59.68 
 
 		 325 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3569  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  61.2 
 
 		 341 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.0448669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1119  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  59.68 
 
 		 325 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1091  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  59.68 
 
 		 325 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7029  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  59.8 
 
 		 339 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.844849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1413  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  62.05 
 
 		 337 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  32.63 
 
 		 791 aa  362  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  40.46 
 
 		 666 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  37.29 
 
 		 680 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0387  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  60.13 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3466  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, subunit alpha  61.51 
 
 		 326 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54216  normal  0.0673101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1408  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  60.65 
 
 		 323 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  38.65 
 
 		 617 aa  356  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  33.59 
 
 		 659 aa  356  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  33.44 
 
 		 668 aa  354  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  33.91 
 
 		 658 aa  353  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0928  pyruvate dehydrogenase, E1 component, alpha subunit  59.49 
 
 		 340 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0762  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  63.43 
 
 		 337 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462104  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  32.09 
 
 		 659 aa  347  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  33.69 
 
 		 659 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.41 
 
 		 469 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  49.38 
 
 		 324 aa  336  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.85 
 
 		 467 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.08 
 
 		 726 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  49.54 
 
 		 330 aa  321  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.66 
 
 		 459 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48 
 
 		 465 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20360  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1, alpha and beta subunits  29.69 
 
 		 814 aa  318  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.66 
 
 		 724 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.22 
 
 		 456 aa  317  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.07 
 
 		 474 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  48.62 
 
 		 327 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.14 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.08 
 
 		 465 aa  313  9e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.84 
 
 		 332 aa  312  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46170  pyruvate dehydrogenase E1 alpha subunit  61.99 
 
 		 338 aa  311  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.439745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  29.68 
 
 		 823 aa  309  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.33 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  33.62 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  32.77 
 
 		 729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.04 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0171  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  46.03 
 
 		 331 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.04 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  43.93 
 
 		 325 aa  308  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  44.72 
 
 		 332 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  45.82 
 
 		 326 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  45.12 
 
 		 332 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  44.24 
 
 		 328 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.38 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.77 
 
 		 468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2013  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  48.46 
 
 		 353 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.441029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  47.66 
 
 		 327 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  32.63 
 
 		 729 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.04 
 
 		 480 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  47.19 
 
 		 322 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.58 
 
 		 331 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.46 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.44 
 
 		 332 aa  303  6.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.13 
 
 		 328 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.07 
 
 		 469 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1728  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  48.15 
 
 		 350 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.21 
 
 		 451 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.41 
 
 		 448 aa  302  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.43 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.74 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.09 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  42.81 
 
 		 325 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.41 
 
 		 461 aa  301  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  46.88 
 
 		 322 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  33.91 
 
 		 728 aa  301  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.71 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  47.24 
 
 		 337 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.79 
 
 		 332 aa  300  5e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5455  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  42.77 
 
 		 336 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.993819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  42.19 
 
 		 326 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>