More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2759 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  100 
 
 		 454 aa  912    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  74.72 
 
 		 456 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.36 
 
 		 483 aa  631  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.46 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.09 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.67 
 
 		 467 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  68.03 
 
 		 460 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.32 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.9 
 
 		 480 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.27 
 
 		 480 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.53 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.31 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.73 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.46 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.99 
 
 		 456 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.38 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.81 
 
 		 461 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.88 
 
 		 469 aa  601  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.17 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.63 
 
 		 497 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  67.24 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.8 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.85 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.72 
 
 		 465 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.07 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.58 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.85 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.35 
 
 		 461 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.45 
 
 		 461 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.78 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.94 
 
 		 454 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.58 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.02 
 
 		 448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.23 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.47 
 
 		 464 aa  571  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.44 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.28 
 
 		 466 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.89 
 
 		 449 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  63.52 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  62.72 
 
 		 458 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.15 
 
 		 448 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1909  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.38 
 
 		 461 aa  542  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0434985  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  65.05 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  64.24 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  66.87 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  63.19 
 
 		 327 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  63.91 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  61.54 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  61.54 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  59.2 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  59.33 
 
 		 332 aa  401  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  55.83 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  58.23 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  56.75 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  54.91 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  56.27 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  55.35 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  57.67 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  53.68 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  54.37 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  53.07 
 
 		 325 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  54.77 
 
 		 327 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  53.07 
 
 		 325 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  52.32 
 
 		 332 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  53.27 
 
 		 328 aa  351  2e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  52.63 
 
 		 332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  52.65 
 
 		 328 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  51.08 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  49.22 
 
 		 322 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  51.53 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  50.31 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  48.6 
 
 		 322 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  51.72 
 
 		 331 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  48.6 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  52.32 
 
 		 328 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  48.29 
 
 		 328 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  50.47 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  49.04 
 
 		 327 aa  315  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  53.16 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  50.31 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  46.32 
 
 		 327 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.32 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  48.6 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  48.6 
 
 		 343 aa  309  8e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0386  transketolase  50.31 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  46.13 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1190  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.84 
 
 		 327 aa  307  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  46.42 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  46.42 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.82 
 
 		 329 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  50.62 
 
 		 330 aa  306  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  48.92 
 
 		 325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.51 
 
 		 329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  49.85 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.82 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3602  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  48.6 
 
 		 334 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  45.11 
 
 		 327 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.98 
 
 		 327 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  45.96 
 
 		 325 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.25 
 
 		 327 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>