More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1966 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  100 
 
 
326 aa  648    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  79.14 
 
 
326 aa  524  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  78.83 
 
 
326 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  79.38 
 
 
325 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  77.47 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  80.37 
 
 
326 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  80.37 
 
 
326 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  70.55 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  65.34 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  65.64 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  72.19 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  67.59 
 
 
324 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  67.28 
 
 
324 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  69.23 
 
 
355 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  68.32 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  66.88 
 
 
333 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001584  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component beta subunit  62.65 
 
 
327 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  67.3 
 
 
333 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  66.46 
 
 
328 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05554  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit  62.35 
 
 
327 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  57.94 
 
 
342 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  58.57 
 
 
346 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  59.88 
 
 
320 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  59.26 
 
 
320 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  57.19 
 
 
336 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  59.74 
 
 
327 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  56.79 
 
 
320 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  53.97 
 
 
325 aa  355  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  59.13 
 
 
320 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  53.05 
 
 
320 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  58.02 
 
 
320 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  53.27 
 
 
327 aa  348  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  53.4 
 
 
326 aa  348  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  54.66 
 
 
332 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  52.94 
 
 
324 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  52.94 
 
 
324 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.94 
 
 
324 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  53.58 
 
 
328 aa  345  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  52.94 
 
 
324 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  54.06 
 
 
326 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  54.32 
 
 
325 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  52.96 
 
 
335 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  54.37 
 
 
323 aa  335  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  49.69 
 
 
326 aa  332  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  49.54 
 
 
325 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.84 
 
 
325 aa  326  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  49.23 
 
 
325 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  54.34 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.82 
 
 
337 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  51.55 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  47.99 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  52.2 
 
 
702 aa  318  7e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  50.62 
 
 
324 aa  318  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  53.58 
 
 
334 aa  317  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 
325 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  45.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  45.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.68 
 
 
325 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  47.37 
 
 
325 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  51.39 
 
 
329 aa  315  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  47.06 
 
 
325 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  50.93 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  50.77 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  50.62 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  48.09 
 
 
337 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  46.45 
 
 
345 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  48.81 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  50.15 
 
 
329 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  47.83 
 
 
327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.33 
 
 
337 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  50.62 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  50.77 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  47.84 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  49.69 
 
 
322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.02 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  46.92 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.33 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.4 
 
 
341 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  50.94 
 
 
326 aa  305  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  47.92 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4287  Transketolase central region  51.52 
 
 
327 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  46.33 
 
 
337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  49.85 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.11 
 
 
352 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.86 
 
 
351 aa  302  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  46.18 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35860  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.52 
 
 
393 aa  302  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2993  2-oxoisovalerate dehydrogenase (beta subunit)  45.59 
 
 
350 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  49.22 
 
 
340 aa  301  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4508  transketolase, central region  49.38 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35520  2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta  45.59 
 
 
350 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0580998  hitchhiker  0.00209483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  49.23 
 
 
336 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  45.7 
 
 
339 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  45.86 
 
 
346 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>