More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3932 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3932  Transketolase central region  100 
 
 
336 aa  653    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  50.31 
 
 
324 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  51.33 
 
 
324 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  46.55 
 
 
334 aa  281  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  46.25 
 
 
330 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  47.35 
 
 
327 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  44.38 
 
 
327 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  44.38 
 
 
327 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  48.87 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  45.45 
 
 
324 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.88 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.88 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  46.44 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.25 
 
 
324 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  44.69 
 
 
320 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  46.56 
 
 
324 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  48.25 
 
 
680 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  45.31 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  44.69 
 
 
324 aa  258  9e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  44.35 
 
 
339 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  44.05 
 
 
339 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  46.39 
 
 
320 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  43.57 
 
 
332 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  43.11 
 
 
340 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  44.58 
 
 
331 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  43.11 
 
 
340 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.81 
 
 
325 aa  255  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  44.06 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  44.16 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  42.63 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  42.81 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  43.17 
 
 
332 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.06 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  44.06 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  45.48 
 
 
325 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  45.48 
 
 
325 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  45.48 
 
 
325 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  42.12 
 
 
333 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.06 
 
 
325 aa  252  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0535  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta  45 
 
 
327 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289294  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  42.12 
 
 
333 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  42.41 
 
 
332 aa  251  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  48.44 
 
 
666 aa  252  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  44.97 
 
 
678 aa  251  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  43.64 
 
 
337 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  47.02 
 
 
326 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  42.72 
 
 
328 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.57 
 
 
351 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  45.02 
 
 
675 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  48.15 
 
 
617 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  39.69 
 
 
325 aa  249  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  43.11 
 
 
334 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.34 
 
 
337 aa  249  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  44.95 
 
 
346 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  42.77 
 
 
327 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  43.89 
 
 
325 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  45.51 
 
 
326 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  41.39 
 
 
791 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  40.48 
 
 
341 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  42.67 
 
 
342 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  40.12 
 
 
330 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  41.32 
 
 
339 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  41.69 
 
 
320 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  44.85 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  41.67 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.39 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3317  transketolase central region  48.74 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  42.06 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  46.71 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.32 
 
 
454 aa  243  3e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  41.43 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  39.43 
 
 
328 aa  243  5e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.03 
 
 
461 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  41.56 
 
 
322 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  45.4 
 
 
332 aa  242  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  40.31 
 
 
328 aa  242  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.01 
 
 
459 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  40.94 
 
 
324 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  40.31 
 
 
325 aa  241  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  41.87 
 
 
347 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  41.51 
 
 
322 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  44.83 
 
 
320 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.03 
 
 
463 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  41.41 
 
 
341 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  40.62 
 
 
324 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  42.25 
 
 
341 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  44.38 
 
 
346 aa  240  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.33 
 
 
332 aa  240  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  48.6 
 
 
325 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  40.9 
 
 
332 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.69 
 
 
449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  45.68 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  44.24 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  41.64 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  43.25 
 
 
338 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  44.68 
 
 
335 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.04 
 
 
465 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  45.14 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  43.67 
 
 
334 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  38.56 
 
 
325 aa  238  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>