More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1944 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  100 
 
 
325 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  67.59 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  65.74 
 
 
325 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  46.11 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  46.11 
 
 
333 aa  288  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1047  transketolase, central region  50.94 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0574878  normal  0.0597249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  46.39 
 
 
324 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  44.24 
 
 
328 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  46.86 
 
 
320 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  44.76 
 
 
327 aa  278  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  47.68 
 
 
324 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  43.34 
 
 
327 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  43.34 
 
 
327 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5078  Transketolase central region  49.22 
 
 
322 aa  275  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  46.85 
 
 
334 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.27 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.6 
 
 
337 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.96 
 
 
454 aa  271  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  47.02 
 
 
324 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  47.6 
 
 
330 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  46.54 
 
 
332 aa  268  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 
344 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.88 
 
 
344 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 
344 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 
344 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  46.35 
 
 
328 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.88 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  46.83 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.86 
 
 
332 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 
344 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.88 
 
 
344 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 
344 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.52 
 
 
324 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  44.58 
 
 
328 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.91 
 
 
448 aa  265  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.58 
 
 
344 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  43.11 
 
 
340 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  43.03 
 
 
339 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.28 
 
 
344 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.69 
 
 
323 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  43.11 
 
 
340 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  43.11 
 
 
340 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  41.3 
 
 
325 aa  263  4e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  44.51 
 
 
337 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  45.08 
 
 
325 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  45.08 
 
 
325 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  45.08 
 
 
325 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  46.27 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1190  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.49 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407117  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1400  Transketolase central region  46.01 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000179702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  39.94 
 
 
325 aa  262  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.52 
 
 
326 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  43.52 
 
 
326 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  45.48 
 
 
337 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  47.65 
 
 
324 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  46.97 
 
 
334 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.14 
 
 
327 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.85 
 
 
338 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  43.41 
 
 
339 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  41.3 
 
 
326 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  47.38 
 
 
327 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  42.49 
 
 
327 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.53 
 
 
327 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.72 
 
 
327 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  41.49 
 
 
325 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  47.15 
 
 
334 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  46.36 
 
 
334 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1382  transketolase, central region  45.54 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.14 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  45.21 
 
 
338 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.08 
 
 
324 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44 
 
 
480 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  47.02 
 
 
327 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  45.08 
 
 
327 aa  258  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.08 
 
 
465 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  41.85 
 
 
327 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  46.85 
 
 
334 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  41.85 
 
 
327 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  46.22 
 
 
336 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.3 
 
 
461 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.35 
 
 
327 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.08 
 
 
324 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.08 
 
 
324 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7030  transketolase central region  42.28 
 
 
324 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520255  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.9 
 
 
461 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.9 
 
 
463 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.3 
 
 
465 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  46.25 
 
 
334 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  46.85 
 
 
334 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  39.81 
 
 
327 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.83 
 
 
329 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.15 
 
 
344 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  40.92 
 
 
326 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  41.61 
 
 
326 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.46 
 
 
464 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.81 
 
 
331 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.83 
 
 
329 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  42.81 
 
 
337 aa  255  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00420  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  47.44 
 
 
343 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  46.08 
 
 
327 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.272287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>